Protein–RNA interactions for Protein: F8VQM2

Ccl26, Chemokine (C-C motif) ligand 26, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl26F8VQM2 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccl26F8VQM2 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccl26F8VQM2 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccl26F8VQM2 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccl26F8VQM2 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccl26F8VQM2 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccl26F8VQM2 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccl26F8VQM2 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccl26F8VQM2 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccl26F8VQM2 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccl26F8VQM2 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccl26F8VQM2 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccl26F8VQM2 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccl26F8VQM2 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccl26F8VQM2 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccl26F8VQM2 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccl26F8VQM2 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccl26F8VQM2 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccl26F8VQM2 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccl26F8VQM2 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccl26F8VQM2 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccl26F8VQM2 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccl26F8VQM2 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccl26F8VQM2 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccl26F8VQM2 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccl26F8VQM2 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccl26F8VQM2 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccl26F8VQM2 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccl26F8VQM2 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccl26F8VQM2 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccl26F8VQM2 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccl26F8VQM2 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccl26F8VQM2 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccl26F8VQM2 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccl26F8VQM2 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccl26F8VQM2 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccl26F8VQM2 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccl26F8VQM2 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccl26F8VQM2 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccl26F8VQM2 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccl26F8VQM2 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccl26F8VQM2 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccl26F8VQM2 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccl26F8VQM2 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccl26F8VQM2 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccl26F8VQM2 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccl26F8VQM2 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccl26F8VQM2 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccl26F8VQM2 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccl26F8VQM2 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccl26F8VQM2 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccl26F8VQM2 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccl26F8VQM2 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccl26F8VQM2 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccl26F8VQM2 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccl26F8VQM2 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccl26F8VQM2 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccl26F8VQM2 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccl26F8VQM2 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccl26F8VQM2 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccl26F8VQM2 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccl26F8VQM2 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccl26F8VQM2 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccl26F8VQM2 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccl26F8VQM2 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccl26F8VQM2 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccl26F8VQM2 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccl26F8VQM2 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccl26F8VQM2 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccl26F8VQM2 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccl26F8VQM2 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccl26F8VQM2 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccl26F8VQM2 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccl26F8VQM2 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccl26F8VQM2 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccl26F8VQM2 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccl26F8VQM2 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccl26F8VQM2 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccl26F8VQM2 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccl26F8VQM2 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccl26F8VQM2 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccl26F8VQM2 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccl26F8VQM2 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccl26F8VQM2 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccl26F8VQM2 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccl26F8VQM2 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccl26F8VQM2 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccl26F8VQM2 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccl26F8VQM2 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccl26F8VQM2 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccl26F8VQM2 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccl26F8VQM2 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccl26F8VQM2 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccl26F8VQM2 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccl26F8VQM2 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccl26F8VQM2 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccl26F8VQM2 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccl26F8VQM2 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccl26F8VQM2 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccl26F8VQM2 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms