Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4Y8

8030474K03Rik, RIKEN cDNA 8030474K03 gene, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
8030474K03RikE9Q4Y8 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
8030474K03RikE9Q4Y8 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
8030474K03RikE9Q4Y8 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
8030474K03RikE9Q4Y8 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
8030474K03RikE9Q4Y8 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
8030474K03RikE9Q4Y8 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
8030474K03RikE9Q4Y8 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
8030474K03RikE9Q4Y8 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
8030474K03RikE9Q4Y8 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
8030474K03RikE9Q4Y8 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
8030474K03RikE9Q4Y8 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
8030474K03RikE9Q4Y8 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
8030474K03RikE9Q4Y8 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
8030474K03RikE9Q4Y8 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
8030474K03RikE9Q4Y8 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
8030474K03RikE9Q4Y8 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
8030474K03RikE9Q4Y8 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
8030474K03RikE9Q4Y8 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
8030474K03RikE9Q4Y8 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
8030474K03RikE9Q4Y8 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
8030474K03RikE9Q4Y8 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
8030474K03RikE9Q4Y8 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
8030474K03RikE9Q4Y8 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
8030474K03RikE9Q4Y8 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
8030474K03RikE9Q4Y8 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
8030474K03RikE9Q4Y8 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
8030474K03RikE9Q4Y8 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
8030474K03RikE9Q4Y8 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
8030474K03RikE9Q4Y8 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
8030474K03RikE9Q4Y8 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
8030474K03RikE9Q4Y8 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
8030474K03RikE9Q4Y8 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
8030474K03RikE9Q4Y8 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
8030474K03RikE9Q4Y8 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
8030474K03RikE9Q4Y8 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
8030474K03RikE9Q4Y8 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
8030474K03RikE9Q4Y8 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
8030474K03RikE9Q4Y8 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
8030474K03RikE9Q4Y8 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
8030474K03RikE9Q4Y8 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
8030474K03RikE9Q4Y8 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
8030474K03RikE9Q4Y8 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
8030474K03RikE9Q4Y8 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
8030474K03RikE9Q4Y8 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
8030474K03RikE9Q4Y8 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
8030474K03RikE9Q4Y8 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
8030474K03RikE9Q4Y8 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
8030474K03RikE9Q4Y8 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
8030474K03RikE9Q4Y8 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
8030474K03RikE9Q4Y8 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
8030474K03RikE9Q4Y8 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
8030474K03RikE9Q4Y8 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
8030474K03RikE9Q4Y8 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
8030474K03RikE9Q4Y8 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
8030474K03RikE9Q4Y8 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
8030474K03RikE9Q4Y8 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
8030474K03RikE9Q4Y8 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
8030474K03RikE9Q4Y8 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
8030474K03RikE9Q4Y8 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
8030474K03RikE9Q4Y8 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
8030474K03RikE9Q4Y8 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
8030474K03RikE9Q4Y8 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
8030474K03RikE9Q4Y8 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
8030474K03RikE9Q4Y8 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
8030474K03RikE9Q4Y8 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
8030474K03RikE9Q4Y8 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
8030474K03RikE9Q4Y8 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
8030474K03RikE9Q4Y8 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
8030474K03RikE9Q4Y8 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
8030474K03RikE9Q4Y8 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
8030474K03RikE9Q4Y8 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
8030474K03RikE9Q4Y8 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
8030474K03RikE9Q4Y8 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
8030474K03RikE9Q4Y8 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
8030474K03RikE9Q4Y8 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
8030474K03RikE9Q4Y8 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
8030474K03RikE9Q4Y8 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
8030474K03RikE9Q4Y8 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
8030474K03RikE9Q4Y8 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
8030474K03RikE9Q4Y8 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
8030474K03RikE9Q4Y8 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
8030474K03RikE9Q4Y8 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
8030474K03RikE9Q4Y8 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
8030474K03RikE9Q4Y8 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
8030474K03RikE9Q4Y8 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
8030474K03RikE9Q4Y8 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
8030474K03RikE9Q4Y8 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
8030474K03RikE9Q4Y8 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
8030474K03RikE9Q4Y8 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
8030474K03RikE9Q4Y8 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
8030474K03RikE9Q4Y8 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
8030474K03RikE9Q4Y8 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
8030474K03RikE9Q4Y8 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
8030474K03RikE9Q4Y8 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
8030474K03RikE9Q4Y8 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
8030474K03RikE9Q4Y8 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
8030474K03RikE9Q4Y8 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
8030474K03RikE9Q4Y8 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
8030474K03RikE9Q4Y8 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
8030474K03RikE9Q4Y8 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms