Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5T8

4930407I10Rik, RIKEN cDNA 4930407I10 gene, mousemouse

Predictions only

Length 1,512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930407I10RikD3Z5T8 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
4930407I10RikD3Z5T8 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
4930407I10RikD3Z5T8 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
4930407I10RikD3Z5T8 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
4930407I10RikD3Z5T8 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
4930407I10RikD3Z5T8 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
4930407I10RikD3Z5T8 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
4930407I10RikD3Z5T8 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
4930407I10RikD3Z5T8 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
4930407I10RikD3Z5T8 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
4930407I10RikD3Z5T8 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
4930407I10RikD3Z5T8 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
4930407I10RikD3Z5T8 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
4930407I10RikD3Z5T8 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC29.78■■■□□ 2.36
4930407I10RikD3Z5T8 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
4930407I10RikD3Z5T8 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
4930407I10RikD3Z5T8 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC29.76■■■□□ 2.36
4930407I10RikD3Z5T8 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
4930407I10RikD3Z5T8 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC29.76■■■□□ 2.35
4930407I10RikD3Z5T8 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
4930407I10RikD3Z5T8 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
4930407I10RikD3Z5T8 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
4930407I10RikD3Z5T8 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
4930407I10RikD3Z5T8 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
4930407I10RikD3Z5T8 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC29.75■■■□□ 2.35
4930407I10RikD3Z5T8 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
4930407I10RikD3Z5T8 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
4930407I10RikD3Z5T8 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
4930407I10RikD3Z5T8 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
4930407I10RikD3Z5T8 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
4930407I10RikD3Z5T8 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
4930407I10RikD3Z5T8 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
4930407I10RikD3Z5T8 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
4930407I10RikD3Z5T8 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
4930407I10RikD3Z5T8 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
4930407I10RikD3Z5T8 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
4930407I10RikD3Z5T8 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
4930407I10RikD3Z5T8 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
4930407I10RikD3Z5T8 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
4930407I10RikD3Z5T8 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
4930407I10RikD3Z5T8 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
4930407I10RikD3Z5T8 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
4930407I10RikD3Z5T8 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
4930407I10RikD3Z5T8 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
4930407I10RikD3Z5T8 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
4930407I10RikD3Z5T8 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
4930407I10RikD3Z5T8 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
4930407I10RikD3Z5T8 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
4930407I10RikD3Z5T8 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
4930407I10RikD3Z5T8 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
4930407I10RikD3Z5T8 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
4930407I10RikD3Z5T8 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
4930407I10RikD3Z5T8 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC29.7■■■□□ 2.34
4930407I10RikD3Z5T8 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
4930407I10RikD3Z5T8 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.34
4930407I10RikD3Z5T8 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
4930407I10RikD3Z5T8 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
4930407I10RikD3Z5T8 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
4930407I10RikD3Z5T8 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
4930407I10RikD3Z5T8 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
4930407I10RikD3Z5T8 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC29.69■■■□□ 2.34
4930407I10RikD3Z5T8 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
4930407I10RikD3Z5T8 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
4930407I10RikD3Z5T8 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
4930407I10RikD3Z5T8 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
4930407I10RikD3Z5T8 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
4930407I10RikD3Z5T8 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
4930407I10RikD3Z5T8 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
4930407I10RikD3Z5T8 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC29.66■■■□□ 2.34
4930407I10RikD3Z5T8 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
4930407I10RikD3Z5T8 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
4930407I10RikD3Z5T8 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
4930407I10RikD3Z5T8 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
4930407I10RikD3Z5T8 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC29.66■■■□□ 2.34
4930407I10RikD3Z5T8 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
4930407I10RikD3Z5T8 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
4930407I10RikD3Z5T8 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
4930407I10RikD3Z5T8 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
4930407I10RikD3Z5T8 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
4930407I10RikD3Z5T8 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
4930407I10RikD3Z5T8 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
4930407I10RikD3Z5T8 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
4930407I10RikD3Z5T8 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
4930407I10RikD3Z5T8 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
4930407I10RikD3Z5T8 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
4930407I10RikD3Z5T8 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
4930407I10RikD3Z5T8 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
4930407I10RikD3Z5T8 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
4930407I10RikD3Z5T8 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
4930407I10RikD3Z5T8 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
4930407I10RikD3Z5T8 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
4930407I10RikD3Z5T8 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
4930407I10RikD3Z5T8 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
4930407I10RikD3Z5T8 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
4930407I10RikD3Z5T8 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
4930407I10RikD3Z5T8 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
4930407I10RikD3Z5T8 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
4930407I10RikD3Z5T8 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
4930407I10RikD3Z5T8 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
4930407I10RikD3Z5T8 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms