Protein–RNA interactions for Protein: B9EHI3

1700006A11Rik, 1700006A11Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700006A11RikB9EHI3 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
1700006A11RikB9EHI3 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
1700006A11RikB9EHI3 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
1700006A11RikB9EHI3 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
1700006A11RikB9EHI3 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
1700006A11RikB9EHI3 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
1700006A11RikB9EHI3 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
1700006A11RikB9EHI3 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
1700006A11RikB9EHI3 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
1700006A11RikB9EHI3 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
1700006A11RikB9EHI3 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
1700006A11RikB9EHI3 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
1700006A11RikB9EHI3 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
1700006A11RikB9EHI3 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
1700006A11RikB9EHI3 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
1700006A11RikB9EHI3 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
1700006A11RikB9EHI3 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
1700006A11RikB9EHI3 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
1700006A11RikB9EHI3 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
1700006A11RikB9EHI3 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
1700006A11RikB9EHI3 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
1700006A11RikB9EHI3 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
1700006A11RikB9EHI3 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
1700006A11RikB9EHI3 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
1700006A11RikB9EHI3 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
1700006A11RikB9EHI3 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
1700006A11RikB9EHI3 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
1700006A11RikB9EHI3 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
1700006A11RikB9EHI3 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
1700006A11RikB9EHI3 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
1700006A11RikB9EHI3 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
1700006A11RikB9EHI3 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
1700006A11RikB9EHI3 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
1700006A11RikB9EHI3 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
1700006A11RikB9EHI3 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
1700006A11RikB9EHI3 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
1700006A11RikB9EHI3 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
1700006A11RikB9EHI3 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
1700006A11RikB9EHI3 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
1700006A11RikB9EHI3 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
1700006A11RikB9EHI3 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
1700006A11RikB9EHI3 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
1700006A11RikB9EHI3 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
1700006A11RikB9EHI3 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
1700006A11RikB9EHI3 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
1700006A11RikB9EHI3 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
1700006A11RikB9EHI3 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
1700006A11RikB9EHI3 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
1700006A11RikB9EHI3 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
1700006A11RikB9EHI3 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
1700006A11RikB9EHI3 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
1700006A11RikB9EHI3 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
1700006A11RikB9EHI3 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
1700006A11RikB9EHI3 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
1700006A11RikB9EHI3 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
1700006A11RikB9EHI3 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
1700006A11RikB9EHI3 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
1700006A11RikB9EHI3 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
1700006A11RikB9EHI3 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
1700006A11RikB9EHI3 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
1700006A11RikB9EHI3 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
1700006A11RikB9EHI3 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
1700006A11RikB9EHI3 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
1700006A11RikB9EHI3 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
1700006A11RikB9EHI3 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
1700006A11RikB9EHI3 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
1700006A11RikB9EHI3 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
1700006A11RikB9EHI3 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
1700006A11RikB9EHI3 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
1700006A11RikB9EHI3 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
1700006A11RikB9EHI3 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
1700006A11RikB9EHI3 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
1700006A11RikB9EHI3 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
1700006A11RikB9EHI3 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
1700006A11RikB9EHI3 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
1700006A11RikB9EHI3 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
1700006A11RikB9EHI3 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
1700006A11RikB9EHI3 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
1700006A11RikB9EHI3 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
1700006A11RikB9EHI3 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
1700006A11RikB9EHI3 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
1700006A11RikB9EHI3 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
1700006A11RikB9EHI3 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
1700006A11RikB9EHI3 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
1700006A11RikB9EHI3 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
1700006A11RikB9EHI3 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
1700006A11RikB9EHI3 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
1700006A11RikB9EHI3 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
1700006A11RikB9EHI3 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
1700006A11RikB9EHI3 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
1700006A11RikB9EHI3 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
1700006A11RikB9EHI3 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
1700006A11RikB9EHI3 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
1700006A11RikB9EHI3 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
1700006A11RikB9EHI3 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
1700006A11RikB9EHI3 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
1700006A11RikB9EHI3 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
1700006A11RikB9EHI3 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
1700006A11RikB9EHI3 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
1700006A11RikB9EHI3 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms