Protein–RNA interactions for Protein: B2RX88

Cspp1, Centrosome and spindle pole associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cspp1B2RX88 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cspp1B2RX88 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Cspp1B2RX88 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Cspp1B2RX88 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cspp1B2RX88 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cspp1B2RX88 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cspp1B2RX88 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cspp1B2RX88 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cspp1B2RX88 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cspp1B2RX88 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cspp1B2RX88 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cspp1B2RX88 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cspp1B2RX88 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cspp1B2RX88 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cspp1B2RX88 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cspp1B2RX88 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cspp1B2RX88 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cspp1B2RX88 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cspp1B2RX88 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cspp1B2RX88 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Cspp1B2RX88 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cspp1B2RX88 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cspp1B2RX88 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cspp1B2RX88 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cspp1B2RX88 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cspp1B2RX88 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cspp1B2RX88 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cspp1B2RX88 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cspp1B2RX88 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cspp1B2RX88 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cspp1B2RX88 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cspp1B2RX88 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cspp1B2RX88 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cspp1B2RX88 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cspp1B2RX88 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cspp1B2RX88 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cspp1B2RX88 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Cspp1B2RX88 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cspp1B2RX88 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cspp1B2RX88 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cspp1B2RX88 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cspp1B2RX88 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cspp1B2RX88 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cspp1B2RX88 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cspp1B2RX88 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cspp1B2RX88 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cspp1B2RX88 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cspp1B2RX88 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cspp1B2RX88 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cspp1B2RX88 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cspp1B2RX88 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cspp1B2RX88 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cspp1B2RX88 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cspp1B2RX88 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cspp1B2RX88 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cspp1B2RX88 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cspp1B2RX88 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cspp1B2RX88 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cspp1B2RX88 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cspp1B2RX88 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cspp1B2RX88 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Cspp1B2RX88 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cspp1B2RX88 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cspp1B2RX88 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cspp1B2RX88 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cspp1B2RX88 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cspp1B2RX88 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cspp1B2RX88 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cspp1B2RX88 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cspp1B2RX88 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cspp1B2RX88 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cspp1B2RX88 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Cspp1B2RX88 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cspp1B2RX88 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cspp1B2RX88 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cspp1B2RX88 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cspp1B2RX88 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cspp1B2RX88 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Cspp1B2RX88 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Cspp1B2RX88 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cspp1B2RX88 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cspp1B2RX88 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cspp1B2RX88 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cspp1B2RX88 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cspp1B2RX88 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cspp1B2RX88 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cspp1B2RX88 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cspp1B2RX88 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cspp1B2RX88 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cspp1B2RX88 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cspp1B2RX88 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Cspp1B2RX88 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cspp1B2RX88 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Cspp1B2RX88 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cspp1B2RX88 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cspp1B2RX88 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cspp1B2RX88 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Cspp1B2RX88 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cspp1B2RX88 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cspp1B2RX88 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms