Protein–RNA interactions for Protein: B1AVP0

Phactr2, Phosphatase and actin regulator, mousemouse

Predictions only

Length 632 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phactr2B1AVP0 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Phactr2B1AVP0 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Phactr2B1AVP0 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Phactr2B1AVP0 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Phactr2B1AVP0 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Phactr2B1AVP0 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Phactr2B1AVP0 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Phactr2B1AVP0 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Phactr2B1AVP0 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Phactr2B1AVP0 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Phactr2B1AVP0 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Phactr2B1AVP0 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Phactr2B1AVP0 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Phactr2B1AVP0 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Phactr2B1AVP0 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Phactr2B1AVP0 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Phactr2B1AVP0 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Phactr2B1AVP0 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Phactr2B1AVP0 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Phactr2B1AVP0 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Phactr2B1AVP0 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Phactr2B1AVP0 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Phactr2B1AVP0 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Phactr2B1AVP0 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Phactr2B1AVP0 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Phactr2B1AVP0 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Phactr2B1AVP0 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Phactr2B1AVP0 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Phactr2B1AVP0 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Phactr2B1AVP0 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Phactr2B1AVP0 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Phactr2B1AVP0 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Phactr2B1AVP0 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Phactr2B1AVP0 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Phactr2B1AVP0 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Phactr2B1AVP0 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Phactr2B1AVP0 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Phactr2B1AVP0 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Phactr2B1AVP0 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Phactr2B1AVP0 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Phactr2B1AVP0 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Phactr2B1AVP0 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Phactr2B1AVP0 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Phactr2B1AVP0 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Phactr2B1AVP0 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Phactr2B1AVP0 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Phactr2B1AVP0 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Phactr2B1AVP0 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Phactr2B1AVP0 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Phactr2B1AVP0 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Phactr2B1AVP0 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Phactr2B1AVP0 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Phactr2B1AVP0 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Phactr2B1AVP0 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Phactr2B1AVP0 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Phactr2B1AVP0 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Phactr2B1AVP0 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Phactr2B1AVP0 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Phactr2B1AVP0 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Phactr2B1AVP0 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Phactr2B1AVP0 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Phactr2B1AVP0 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Phactr2B1AVP0 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Phactr2B1AVP0 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Phactr2B1AVP0 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Phactr2B1AVP0 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Phactr2B1AVP0 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Phactr2B1AVP0 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Phactr2B1AVP0 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Phactr2B1AVP0 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Phactr2B1AVP0 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Phactr2B1AVP0 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Phactr2B1AVP0 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Phactr2B1AVP0 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Phactr2B1AVP0 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Phactr2B1AVP0 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Phactr2B1AVP0 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Phactr2B1AVP0 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Phactr2B1AVP0 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Phactr2B1AVP0 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Phactr2B1AVP0 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Phactr2B1AVP0 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Phactr2B1AVP0 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Phactr2B1AVP0 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Phactr2B1AVP0 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Phactr2B1AVP0 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Phactr2B1AVP0 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Phactr2B1AVP0 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Phactr2B1AVP0 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Phactr2B1AVP0 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Phactr2B1AVP0 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Phactr2B1AVP0 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Phactr2B1AVP0 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Phactr2B1AVP0 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Phactr2B1AVP0 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Phactr2B1AVP0 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Phactr2B1AVP0 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Phactr2B1AVP0 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Phactr2B1AVP0 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Phactr2B1AVP0 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms