Protein–RNA interactions for Protein: A2BFR3

H2al1j, Histone H2A, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1jA2BFR3 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2al1jA2BFR3 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2al1jA2BFR3 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2al1jA2BFR3 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2al1jA2BFR3 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2al1jA2BFR3 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2al1jA2BFR3 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2al1jA2BFR3 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2al1jA2BFR3 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2al1jA2BFR3 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2al1jA2BFR3 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2al1jA2BFR3 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2al1jA2BFR3 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2al1jA2BFR3 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2al1jA2BFR3 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2al1jA2BFR3 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2al1jA2BFR3 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2al1jA2BFR3 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2al1jA2BFR3 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2al1jA2BFR3 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2al1jA2BFR3 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2al1jA2BFR3 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2al1jA2BFR3 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2al1jA2BFR3 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2al1jA2BFR3 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2al1jA2BFR3 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2al1jA2BFR3 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2al1jA2BFR3 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2al1jA2BFR3 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2al1jA2BFR3 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2al1jA2BFR3 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2al1jA2BFR3 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2al1jA2BFR3 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2al1jA2BFR3 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2al1jA2BFR3 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2al1jA2BFR3 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2al1jA2BFR3 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2al1jA2BFR3 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2al1jA2BFR3 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2al1jA2BFR3 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2al1jA2BFR3 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2al1jA2BFR3 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2al1jA2BFR3 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2al1jA2BFR3 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2al1jA2BFR3 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2al1jA2BFR3 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2al1jA2BFR3 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2al1jA2BFR3 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
H2al1jA2BFR3 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
H2al1jA2BFR3 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
H2al1jA2BFR3 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
H2al1jA2BFR3 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
H2al1jA2BFR3 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2al1jA2BFR3 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
H2al1jA2BFR3 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2al1jA2BFR3 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2al1jA2BFR3 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2al1jA2BFR3 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2al1jA2BFR3 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2al1jA2BFR3 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2al1jA2BFR3 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
H2al1jA2BFR3 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2al1jA2BFR3 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2al1jA2BFR3 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2al1jA2BFR3 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
H2al1jA2BFR3 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2al1jA2BFR3 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
H2al1jA2BFR3 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC16■□□□□ 0.15
H2al1jA2BFR3 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
H2al1jA2BFR3 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC16■□□□□ 0.15
H2al1jA2BFR3 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2al1jA2BFR3 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2al1jA2BFR3 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
H2al1jA2BFR3 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2al1jA2BFR3 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2al1jA2BFR3 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
H2al1jA2BFR3 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
H2al1jA2BFR3 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2al1jA2BFR3 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2al1jA2BFR3 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2al1jA2BFR3 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2al1jA2BFR3 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
H2al1jA2BFR3 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2al1jA2BFR3 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2al1jA2BFR3 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2al1jA2BFR3 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2al1jA2BFR3 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2al1jA2BFR3 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
H2al1jA2BFR3 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2al1jA2BFR3 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2al1jA2BFR3 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2al1jA2BFR3 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2al1jA2BFR3 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2al1jA2BFR3 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2al1jA2BFR3 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2al1jA2BFR3 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2al1jA2BFR3 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2al1jA2BFR3 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2al1jA2BFR3 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2al1jA2BFR3 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms