Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z331

Krt6b, Keratin, type II cytoskeletal 6B, mousemouse

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt6bQ9Z331 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Krt6bQ9Z331 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Krt6bQ9Z331 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Krt6bQ9Z331 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Krt6bQ9Z331 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Krt6bQ9Z331 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Krt6bQ9Z331 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Krt6bQ9Z331 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Krt6bQ9Z331 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Krt6bQ9Z331 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Krt6bQ9Z331 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Krt6bQ9Z331 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Krt6bQ9Z331 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Krt6bQ9Z331 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Krt6bQ9Z331 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Krt6bQ9Z331 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Krt6bQ9Z331 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Krt6bQ9Z331 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Krt6bQ9Z331 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Krt6bQ9Z331 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Krt6bQ9Z331 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Krt6bQ9Z331 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Krt6bQ9Z331 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Krt6bQ9Z331 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Krt6bQ9Z331 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Krt6bQ9Z331 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Krt6bQ9Z331 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Krt6bQ9Z331 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Krt6bQ9Z331 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Krt6bQ9Z331 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Krt6bQ9Z331 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Krt6bQ9Z331 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Krt6bQ9Z331 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Krt6bQ9Z331 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Krt6bQ9Z331 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Krt6bQ9Z331 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Krt6bQ9Z331 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Krt6bQ9Z331 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Krt6bQ9Z331 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Krt6bQ9Z331 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Krt6bQ9Z331 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Krt6bQ9Z331 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Krt6bQ9Z331 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Krt6bQ9Z331 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Krt6bQ9Z331 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Krt6bQ9Z331 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Krt6bQ9Z331 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Krt6bQ9Z331 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Krt6bQ9Z331 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Krt6bQ9Z331 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Krt6bQ9Z331 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Krt6bQ9Z331 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Krt6bQ9Z331 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Krt6bQ9Z331 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Krt6bQ9Z331 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Krt6bQ9Z331 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Krt6bQ9Z331 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Krt6bQ9Z331 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Krt6bQ9Z331 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Krt6bQ9Z331 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Krt6bQ9Z331 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Krt6bQ9Z331 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Krt6bQ9Z331 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Krt6bQ9Z331 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Krt6bQ9Z331 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Krt6bQ9Z331 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Krt6bQ9Z331 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Krt6bQ9Z331 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Krt6bQ9Z331 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Krt6bQ9Z331 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Krt6bQ9Z331 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Krt6bQ9Z331 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Krt6bQ9Z331 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Krt6bQ9Z331 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Krt6bQ9Z331 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Krt6bQ9Z331 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Krt6bQ9Z331 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Krt6bQ9Z331 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Krt6bQ9Z331 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Krt6bQ9Z331 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Krt6bQ9Z331 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Krt6bQ9Z331 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Krt6bQ9Z331 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Krt6bQ9Z331 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Krt6bQ9Z331 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Krt6bQ9Z331 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Krt6bQ9Z331 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Krt6bQ9Z331 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Krt6bQ9Z331 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Krt6bQ9Z331 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Krt6bQ9Z331 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Krt6bQ9Z331 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Krt6bQ9Z331 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Krt6bQ9Z331 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Krt6bQ9Z331 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Krt6bQ9Z331 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Krt6bQ9Z331 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Krt6bQ9Z331 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Krt6bQ9Z331 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Krt6bQ9Z331 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms