Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1J2

Nek4, Serine/threonine-protein kinase Nek4, mousemouse

Predictions only

Length 792 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek4Q9Z1J2 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nek4Q9Z1J2 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nek4Q9Z1J2 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nek4Q9Z1J2 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nek4Q9Z1J2 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nek4Q9Z1J2 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Nek4Q9Z1J2 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nek4Q9Z1J2 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nek4Q9Z1J2 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nek4Q9Z1J2 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nek4Q9Z1J2 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nek4Q9Z1J2 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nek4Q9Z1J2 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Nek4Q9Z1J2 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nek4Q9Z1J2 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nek4Q9Z1J2 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nek4Q9Z1J2 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nek4Q9Z1J2 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nek4Q9Z1J2 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nek4Q9Z1J2 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nek4Q9Z1J2 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nek4Q9Z1J2 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nek4Q9Z1J2 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Nek4Q9Z1J2 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Nek4Q9Z1J2 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nek4Q9Z1J2 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nek4Q9Z1J2 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nek4Q9Z1J2 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nek4Q9Z1J2 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Nek4Q9Z1J2 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nek4Q9Z1J2 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nek4Q9Z1J2 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nek4Q9Z1J2 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nek4Q9Z1J2 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nek4Q9Z1J2 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nek4Q9Z1J2 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nek4Q9Z1J2 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nek4Q9Z1J2 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nek4Q9Z1J2 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nek4Q9Z1J2 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nek4Q9Z1J2 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nek4Q9Z1J2 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nek4Q9Z1J2 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nek4Q9Z1J2 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nek4Q9Z1J2 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nek4Q9Z1J2 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Nek4Q9Z1J2 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Nek4Q9Z1J2 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Nek4Q9Z1J2 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Nek4Q9Z1J2 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Nek4Q9Z1J2 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Nek4Q9Z1J2 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Nek4Q9Z1J2 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nek4Q9Z1J2 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nek4Q9Z1J2 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nek4Q9Z1J2 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nek4Q9Z1J2 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nek4Q9Z1J2 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Nek4Q9Z1J2 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Nek4Q9Z1J2 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Nek4Q9Z1J2 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nek4Q9Z1J2 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Nek4Q9Z1J2 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nek4Q9Z1J2 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nek4Q9Z1J2 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nek4Q9Z1J2 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nek4Q9Z1J2 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Nek4Q9Z1J2 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nek4Q9Z1J2 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nek4Q9Z1J2 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nek4Q9Z1J2 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nek4Q9Z1J2 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nek4Q9Z1J2 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nek4Q9Z1J2 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nek4Q9Z1J2 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nek4Q9Z1J2 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nek4Q9Z1J2 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nek4Q9Z1J2 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nek4Q9Z1J2 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nek4Q9Z1J2 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nek4Q9Z1J2 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nek4Q9Z1J2 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nek4Q9Z1J2 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nek4Q9Z1J2 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nek4Q9Z1J2 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nek4Q9Z1J2 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nek4Q9Z1J2 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nek4Q9Z1J2 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nek4Q9Z1J2 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Nek4Q9Z1J2 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Nek4Q9Z1J2 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nek4Q9Z1J2 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nek4Q9Z1J2 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nek4Q9Z1J2 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nek4Q9Z1J2 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nek4Q9Z1J2 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Nek4Q9Z1J2 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Nek4Q9Z1J2 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nek4Q9Z1J2 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nek4Q9Z1J2 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms