Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S4

Cldn13, Claudin-13, mousemouse

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Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn13Q9Z0S4 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn13Q9Z0S4 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
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