Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Col4a3Q9QZS0 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Col4a3Q9QZS0 Cipc-208ENSMUST00000189246 1454 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Col4a3Q9QZS0 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Col4a3Q9QZS0 Gm14942-201ENSMUST00000119642 336 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Col4a3Q9QZS0 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Col4a3Q9QZS0 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Col4a3Q9QZS0 Spdye4a-202ENSMUST00000160502 1245 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Col4a3Q9QZS0 Rsph14-206ENSMUST00000166088 1203 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Col4a3Q9QZS0 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Col4a3Q9QZS0 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Col4a3Q9QZS0 Mir6998-201ENSMUST00000183343 64 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Col4a3Q9QZS0 Rsph14-201ENSMUST00000009214 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Col4a3Q9QZS0 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Col4a3Q9QZS0 Gm26783-201ENSMUST00000181197 2377 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Col4a3Q9QZS0 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Col4a3Q9QZS0 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Col4a3Q9QZS0 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Col4a3Q9QZS0 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Col4a3Q9QZS0 Gm4900-201ENSMUST00000222046 1628 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Col4a3Q9QZS0 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Col4a3Q9QZS0 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Col4a3Q9QZS0 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Col4a3Q9QZS0 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Col4a3Q9QZS0 Cpsf4l-202ENSMUST00000100248 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Col4a3Q9QZS0 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Col4a3Q9QZS0 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Col4a3Q9QZS0 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Col4a3Q9QZS0 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Col4a3Q9QZS0 Trpm2-201ENSMUST00000105399 731 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Col4a3Q9QZS0 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Col4a3Q9QZS0 Nop56-204ENSMUST00000136621 868 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Col4a3Q9QZS0 Itpr3os-201ENSMUST00000143605 794 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Col4a3Q9QZS0 Gm2875-201ENSMUST00000211333 360 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Col4a3Q9QZS0 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Col4a3Q9QZS0 Gm34045-201ENSMUST00000217700 988 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Col4a3Q9QZS0 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Col4a3Q9QZS0 CT573047.1-201ENSMUST00000223652 851 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Col4a3Q9QZS0 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Col4a3Q9QZS0 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Col4a3Q9QZS0 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Col4a3Q9QZS0 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Col4a3Q9QZS0 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Col4a3Q9QZS0 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Col4a3Q9QZS0 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Col4a3Q9QZS0 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Col4a3Q9QZS0 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Col4a3Q9QZS0 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Col4a3Q9QZS0 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Col4a3Q9QZS0 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Col4a3Q9QZS0 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Col4a3Q9QZS0 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Col4a3Q9QZS0 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Col4a3Q9QZS0 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Col4a3Q9QZS0 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Col4a3Q9QZS0 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Col4a3Q9QZS0 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Col4a3Q9QZS0 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Col4a3Q9QZS0 Gm13384-201ENSMUST00000117166 1344 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Col4a3Q9QZS0 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Col4a3Q9QZS0 Mrps17-204ENSMUST00000119604 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Col4a3Q9QZS0 Gm11211-201ENSMUST00000143618 359 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Col4a3Q9QZS0 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Col4a3Q9QZS0 1700081H04Rik-201ENSMUST00000190550 1128 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Col4a3Q9QZS0 Fabp6-201ENSMUST00000020672 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Col4a3Q9QZS0 AC166341.2-201ENSMUST00000220571 120 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Col4a3Q9QZS0 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Col4a3Q9QZS0 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Col4a3Q9QZS0 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Col4a3Q9QZS0 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Col4a3Q9QZS0 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Col4a3Q9QZS0 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Col4a3Q9QZS0 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Col4a3Q9QZS0 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Col4a3Q9QZS0 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Col4a3Q9QZS0 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Col4a3Q9QZS0 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Col4a3Q9QZS0 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Col4a3Q9QZS0 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Col4a3Q9QZS0 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Col4a3Q9QZS0 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Col4a3Q9QZS0 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Col4a3Q9QZS0 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Col4a3Q9QZS0 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Col4a3Q9QZS0 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Col4a3Q9QZS0 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Col4a3Q9QZS0 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Col4a3Q9QZS0 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Col4a3Q9QZS0 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Col4a3Q9QZS0 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Col4a3Q9QZS0 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Col4a3Q9QZS0 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Col4a3Q9QZS0 Treml4-202ENSMUST00000125426 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Col4a3Q9QZS0 Gm14236-201ENSMUST00000142374 872 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Col4a3Q9QZS0 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Col4a3Q9QZS0 Snhg17-205ENSMUST00000151331 529 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Col4a3Q9QZS0 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Col4a3Q9QZS0 Gm15523-201ENSMUST00000160463 439 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Col4a3Q9QZS0 Gm21778-201ENSMUST00000178779 471 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Col4a3Q9QZS0 Gm7137-201ENSMUST00000180161 711 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms