Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMK2

Csnk1e, Casein kinase I isoform epsilon, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1eQ9JMK2 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Csnk1eQ9JMK2 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Csnk1eQ9JMK2 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Csnk1eQ9JMK2 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Csnk1eQ9JMK2 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Csnk1eQ9JMK2 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Csnk1eQ9JMK2 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Csnk1eQ9JMK2 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Csnk1eQ9JMK2 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Csnk1eQ9JMK2 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Csnk1eQ9JMK2 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Csnk1eQ9JMK2 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Csnk1eQ9JMK2 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Csnk1eQ9JMK2 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Csnk1eQ9JMK2 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Csnk1eQ9JMK2 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Csnk1eQ9JMK2 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Csnk1eQ9JMK2 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Csnk1eQ9JMK2 Gm13182-201ENSMUST00000122241 312 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Csnk1eQ9JMK2 Adap2os-201ENSMUST00000140556 984 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Csnk1eQ9JMK2 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Csnk1eQ9JMK2 Rps28-203ENSMUST00000173019 437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Csnk1eQ9JMK2 Tlx1-202ENSMUST00000174617 806 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Csnk1eQ9JMK2 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Csnk1eQ9JMK2 Gm4654-201ENSMUST00000183305 982 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Csnk1eQ9JMK2 Gm44980-201ENSMUST00000205826 314 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Csnk1eQ9JMK2 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Csnk1eQ9JMK2 1110019B22Rik-202ENSMUST00000218396 989 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Csnk1eQ9JMK2 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Csnk1eQ9JMK2 Nop10-201ENSMUST00000028553 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Csnk1eQ9JMK2 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Csnk1eQ9JMK2 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Csnk1eQ9JMK2 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Csnk1eQ9JMK2 Rsrc1-206ENSMUST00000162036 1406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Csnk1eQ9JMK2 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Csnk1eQ9JMK2 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Csnk1eQ9JMK2 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Csnk1eQ9JMK2 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Csnk1eQ9JMK2 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Csnk1eQ9JMK2 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Csnk1eQ9JMK2 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Csnk1eQ9JMK2 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Csnk1eQ9JMK2 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Csnk1eQ9JMK2 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Csnk1eQ9JMK2 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Csnk1eQ9JMK2 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Csnk1eQ9JMK2 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Csnk1eQ9JMK2 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Csnk1eQ9JMK2 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Csnk1eQ9JMK2 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 Prss46-201ENSMUST00000119427 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 Gm16071-201ENSMUST00000119589 793 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 Mir1901-201ENSMUST00000122616 78 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 Nop56-204ENSMUST00000136621 868 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 Prss46-202ENSMUST00000176403 1257 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 Mir6998-201ENSMUST00000183343 64 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 Gm17826-201ENSMUST00000189720 798 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 Gm44329-201ENSMUST00000197469 112 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 AC027700.1-201ENSMUST00000213965 370 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 AC099645.1-201ENSMUST00000226476 1105 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 1810009A15Rik-201ENSMUST00000096251 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Csnk1eQ9JMK2 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
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