Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF7

Mrpl39, 39S ribosomal protein L39, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl39Q9JKF7 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 Thsd4-206ENSMUST00000171654 8522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 Tubgcp6-201ENSMUST00000041656 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 2700068H02Rik-201ENSMUST00000137882 1872 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 Aar2-202ENSMUST00000109570 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 C730027H18Rik-201ENSMUST00000218381 2300 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 Dclk2-202ENSMUST00000191752 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 Stx1b-201ENSMUST00000106267 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 Gm26642-201ENSMUST00000180981 2782 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 Mrrf-201ENSMUST00000028250 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 Smarca2-209ENSMUST00000176030 5862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 Ncor2-202ENSMUST00000086083 8575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Mrpl39Q9JKF7 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms