Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ1

Tlr1, Toll-like receptor 1, mousemouse

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Length 795 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr1Q9EPQ1 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tlr1Q9EPQ1 Cd300lg-201ENSMUST00000017453 2353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tlr1Q9EPQ1 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tlr1Q9EPQ1 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tlr1Q9EPQ1 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tlr1Q9EPQ1 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tlr1Q9EPQ1 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tlr1Q9EPQ1 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tlr1Q9EPQ1 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tlr1Q9EPQ1 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tlr1Q9EPQ1 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tlr1Q9EPQ1 Thoc5-201ENSMUST00000038237 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tlr1Q9EPQ1 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tlr1Q9EPQ1 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tlr1Q9EPQ1 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tlr1Q9EPQ1 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tlr1Q9EPQ1 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tlr1Q9EPQ1 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tlr1Q9EPQ1 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tlr1Q9EPQ1 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tlr1Q9EPQ1 Irak4-202ENSMUST00000109248 3437 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tlr1Q9EPQ1 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tlr1Q9EPQ1 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tlr1Q9EPQ1 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tlr1Q9EPQ1 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Tlr1Q9EPQ1 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tlr1Q9EPQ1 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tlr1Q9EPQ1 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tlr1Q9EPQ1 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tlr1Q9EPQ1 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tlr1Q9EPQ1 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tlr1Q9EPQ1 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tlr1Q9EPQ1 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tlr1Q9EPQ1 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tlr1Q9EPQ1 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tlr1Q9EPQ1 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tlr1Q9EPQ1 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Tlr1Q9EPQ1 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tlr1Q9EPQ1 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tlr1Q9EPQ1 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tlr1Q9EPQ1 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Tlr1Q9EPQ1 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Tlr1Q9EPQ1 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Tlr1Q9EPQ1 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tlr1Q9EPQ1 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Tlr1Q9EPQ1 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Tlr1Q9EPQ1 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tlr1Q9EPQ1 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tlr1Q9EPQ1 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tlr1Q9EPQ1 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tlr1Q9EPQ1 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tlr1Q9EPQ1 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tlr1Q9EPQ1 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Tlr1Q9EPQ1 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tlr1Q9EPQ1 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tlr1Q9EPQ1 CT010480.4-201ENSMUST00000224654 2283 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Tlr1Q9EPQ1 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tlr1Q9EPQ1 Ntrk3-205ENSMUST00000193002 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tlr1Q9EPQ1 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tlr1Q9EPQ1 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tlr1Q9EPQ1 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tlr1Q9EPQ1 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tlr1Q9EPQ1 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tlr1Q9EPQ1 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tlr1Q9EPQ1 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tlr1Q9EPQ1 Lvrn-201ENSMUST00000025358 3219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tlr1Q9EPQ1 Gm43064-201ENSMUST00000199710 3144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tlr1Q9EPQ1 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tlr1Q9EPQ1 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tlr1Q9EPQ1 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tlr1Q9EPQ1 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tlr1Q9EPQ1 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tlr1Q9EPQ1 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Tlr1Q9EPQ1 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.67
Tlr1Q9EPQ1 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.67
Tlr1Q9EPQ1 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.67
Tlr1Q9EPQ1 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tlr1Q9EPQ1 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tlr1Q9EPQ1 Lhx9-205ENSMUST00000112030 4633 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tlr1Q9EPQ1 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tlr1Q9EPQ1 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tlr1Q9EPQ1 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tlr1Q9EPQ1 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tlr1Q9EPQ1 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tlr1Q9EPQ1 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tlr1Q9EPQ1 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tlr1Q9EPQ1 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tlr1Q9EPQ1 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tlr1Q9EPQ1 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tlr1Q9EPQ1 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tlr1Q9EPQ1 Asb8-204ENSMUST00000143400 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tlr1Q9EPQ1 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tlr1Q9EPQ1 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tlr1Q9EPQ1 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Tlr1Q9EPQ1 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Tlr1Q9EPQ1 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tlr1Q9EPQ1 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Tlr1Q9EPQ1 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tlr1Q9EPQ1 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Tlr1Q9EPQ1 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.5 ms