Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rnft1Q9DCN7 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
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Rnft1Q9DCN7 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rnft1Q9DCN7 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
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Rnft1Q9DCN7 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnft1Q9DCN7 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnft1Q9DCN7 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnft1Q9DCN7 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83 ms