Protein–RNA interactions for Protein: Q9D232

Spns3, Protein spinster homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spns3Q9D232 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Spns3Q9D232 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Spns3Q9D232 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Spns3Q9D232 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Spns3Q9D232 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Spns3Q9D232 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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Spns3Q9D232 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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Spns3Q9D232 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Spns3Q9D232 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Spns3Q9D232 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Spns3Q9D232 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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Spns3Q9D232 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Spns3Q9D232 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Spns3Q9D232 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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Spns3Q9D232 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Spns3Q9D232 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
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Spns3Q9D232 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Spns3Q9D232 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Spns3Q9D232 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Spns3Q9D232 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Spns3Q9D232 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Spns3Q9D232 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Spns3Q9D232 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Spns3Q9D232 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Spns3Q9D232 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Spns3Q9D232 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Spns3Q9D232 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Spns3Q9D232 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Spns3Q9D232 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
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Spns3Q9D232 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Spns3Q9D232 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Spns3Q9D232 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Spns3Q9D232 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Spns3Q9D232 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Spns3Q9D232 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Spns3Q9D232 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Spns3Q9D232 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Spns3Q9D232 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Spns3Q9D232 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Spns3Q9D232 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Spns3Q9D232 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Spns3Q9D232 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Spns3Q9D232 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Spns3Q9D232 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Spns3Q9D232 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Spns3Q9D232 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Spns3Q9D232 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
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Spns3Q9D232 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Spns3Q9D232 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Spns3Q9D232 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Spns3Q9D232 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Spns3Q9D232 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
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Spns3Q9D232 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Spns3Q9D232 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Spns3Q9D232 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Spns3Q9D232 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Spns3Q9D232 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
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Spns3Q9D232 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Spns3Q9D232 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Spns3Q9D232 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Spns3Q9D232 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
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Spns3Q9D232 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Spns3Q9D232 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Spns3Q9D232 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Spns3Q9D232 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Spns3Q9D232 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Spns3Q9D232 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Spns3Q9D232 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Spns3Q9D232 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Spns3Q9D232 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Spns3Q9D232 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Spns3Q9D232 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Spns3Q9D232 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Spns3Q9D232 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Spns3Q9D232 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Spns3Q9D232 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Spns3Q9D232 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Spns3Q9D232 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Spns3Q9D232 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Spns3Q9D232 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms