Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXK8

Nip7, 60S ribosome subunit biogenesis protein NIP7 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nip7Q9CXK8 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nip7Q9CXK8 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nip7Q9CXK8 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nip7Q9CXK8 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nip7Q9CXK8 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nip7Q9CXK8 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nip7Q9CXK8 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nip7Q9CXK8 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nip7Q9CXK8 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Nip7Q9CXK8 Gm11340-201ENSMUST00000119226 412 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Nip7Q9CXK8 Treml4-202ENSMUST00000125426 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nip7Q9CXK8 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nip7Q9CXK8 Gm6407-201ENSMUST00000176468 549 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Nip7Q9CXK8 Gm7137-201ENSMUST00000180161 711 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nip7Q9CXK8 Gm44158-201ENSMUST00000203881 505 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Nip7Q9CXK8 AC118476.3-201ENSMUST00000216419 1219 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nip7Q9CXK8 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nip7Q9CXK8 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nip7Q9CXK8 Krtap6-2-201ENSMUST00000082065 786 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nip7Q9CXK8 n-R5s211-201ENSMUST00000093689 119 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Nip7Q9CXK8 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nip7Q9CXK8 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nip7Q9CXK8 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nip7Q9CXK8 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Nip7Q9CXK8 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nip7Q9CXK8 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nip7Q9CXK8 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Nip7Q9CXK8 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nip7Q9CXK8 Gm3765-201ENSMUST00000130985 1447 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Nip7Q9CXK8 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nip7Q9CXK8 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nip7Q9CXK8 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nip7Q9CXK8 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nip7Q9CXK8 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nip7Q9CXK8 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nip7Q9CXK8 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nip7Q9CXK8 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nip7Q9CXK8 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nip7Q9CXK8 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Nip7Q9CXK8 Gm12248-202ENSMUST00000218429 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nip7Q9CXK8 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nip7Q9CXK8 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nip7Q9CXK8 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nip7Q9CXK8 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Nip7Q9CXK8 Gm28037-201ENSMUST00000122365 611 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nip7Q9CXK8 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nip7Q9CXK8 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nip7Q9CXK8 Nop16-202ENSMUST00000148222 790 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nip7Q9CXK8 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nip7Q9CXK8 D3Ertd751e-215ENSMUST00000195882 680 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nip7Q9CXK8 Gm19091-201ENSMUST00000208120 978 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Nip7Q9CXK8 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Nip7Q9CXK8 Gm45338-204ENSMUST00000210658 1105 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nip7Q9CXK8 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Nip7Q9CXK8 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nip7Q9CXK8 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nip7Q9CXK8 Gm19009-201ENSMUST00000223072 823 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Nip7Q9CXK8 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nip7Q9CXK8 Commd4-201ENSMUST00000065358 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nip7Q9CXK8 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nip7Q9CXK8 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nip7Q9CXK8 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nip7Q9CXK8 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nip7Q9CXK8 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nip7Q9CXK8 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nip7Q9CXK8 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nip7Q9CXK8 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nip7Q9CXK8 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nip7Q9CXK8 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nip7Q9CXK8 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nip7Q9CXK8 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nip7Q9CXK8 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nip7Q9CXK8 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nip7Q9CXK8 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nip7Q9CXK8 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nip7Q9CXK8 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nip7Q9CXK8 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nip7Q9CXK8 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nip7Q9CXK8 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nip7Q9CXK8 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nip7Q9CXK8 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nip7Q9CXK8 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nip7Q9CXK8 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nip7Q9CXK8 Krtap4-6-201ENSMUST00000100476 918 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nip7Q9CXK8 Gm13668-201ENSMUST00000119237 1001 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Nip7Q9CXK8 Igf1-205ENSMUST00000121952 798 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nip7Q9CXK8 Elof1-202ENSMUST00000166335 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nip7Q9CXK8 Dpf3-206ENSMUST00000177959 1298 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nip7Q9CXK8 Gm6771-201ENSMUST00000182716 1001 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Nip7Q9CXK8 Psmb6-201ENSMUST00000018430 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nip7Q9CXK8 Gm27232-201ENSMUST00000184373 597 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nip7Q9CXK8 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nip7Q9CXK8 Gm8531-201ENSMUST00000188319 893 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Nip7Q9CXK8 Cinp-204ENSMUST00000221102 536 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nip7Q9CXK8 AC124433.1-201ENSMUST00000224483 1063 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Nip7Q9CXK8 BC030499-201ENSMUST00000046361 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nip7Q9CXK8 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nip7Q9CXK8 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nip7Q9CXK8 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nip7Q9CXK8 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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