Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE6

Xrcc3, DNA repair protein XRCC3, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc3Q9CXE6 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Xrcc3Q9CXE6 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Xrcc3Q9CXE6 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Xrcc3Q9CXE6 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Xrcc3Q9CXE6 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Xrcc3Q9CXE6 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Xrcc3Q9CXE6 Zbtb21-202ENSMUST00000063605 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Xrcc3Q9CXE6 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Xrcc3Q9CXE6 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Xrcc3Q9CXE6 Armcx4-201ENSMUST00000124226 7996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Xrcc3Q9CXE6 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Xrcc3Q9CXE6 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Xrcc3Q9CXE6 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Xrcc3Q9CXE6 Ica1-204ENSMUST00000115520 1876 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Xrcc3Q9CXE6 Nap1l3-201ENSMUST00000079490 2837 ntAPPRIS P1 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Xrcc3Q9CXE6 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Xrcc3Q9CXE6 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Xrcc3Q9CXE6 Odf2-209ENSMUST00000113764 2450 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Xrcc3Q9CXE6 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Xrcc3Q9CXE6 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Xrcc3Q9CXE6 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Xrcc3Q9CXE6 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Xrcc3Q9CXE6 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Xrcc3Q9CXE6 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Xrcc3Q9CXE6 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Xrcc3Q9CXE6 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Xrcc3Q9CXE6 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Xrcc3Q9CXE6 Trim61-201ENSMUST00000078409 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Xrcc3Q9CXE6 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Xrcc3Q9CXE6 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Xrcc3Q9CXE6 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Xrcc3Q9CXE6 Gm17244-201ENSMUST00000192482 3416 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Xrcc3Q9CXE6 Gm37580-201ENSMUST00000192408 2800 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Xrcc3Q9CXE6 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Xrcc3Q9CXE6 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Xrcc3Q9CXE6 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Xrcc3Q9CXE6 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Xrcc3Q9CXE6 Mcf2l-217ENSMUST00000145067 5313 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Xrcc3Q9CXE6 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Xrcc3Q9CXE6 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Xrcc3Q9CXE6 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Xrcc3Q9CXE6 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Xrcc3Q9CXE6 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Xrcc3Q9CXE6 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Xrcc3Q9CXE6 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Xrcc3Q9CXE6 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Xrcc3Q9CXE6 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Xrcc3Q9CXE6 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Xrcc3Q9CXE6 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Xrcc3Q9CXE6 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Xrcc3Q9CXE6 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Xrcc3Q9CXE6 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Xrcc3Q9CXE6 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Xrcc3Q9CXE6 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Xrcc3Q9CXE6 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Xrcc3Q9CXE6 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Xrcc3Q9CXE6 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Xrcc3Q9CXE6 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Xrcc3Q9CXE6 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Xrcc3Q9CXE6 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Xrcc3Q9CXE6 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Xrcc3Q9CXE6 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Xrcc3Q9CXE6 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Xrcc3Q9CXE6 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Xrcc3Q9CXE6 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Xrcc3Q9CXE6 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Xrcc3Q9CXE6 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Xrcc3Q9CXE6 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Xrcc3Q9CXE6 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Xrcc3Q9CXE6 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Xrcc3Q9CXE6 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Xrcc3Q9CXE6 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Xrcc3Q9CXE6 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Xrcc3Q9CXE6 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Xrcc3Q9CXE6 Gm42141-201ENSMUST00000196534 2172 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Xrcc3Q9CXE6 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Xrcc3Q9CXE6 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Xrcc3Q9CXE6 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Xrcc3Q9CXE6 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Xrcc3Q9CXE6 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Xrcc3Q9CXE6 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Xrcc3Q9CXE6 Rpap2-204ENSMUST00000112654 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Xrcc3Q9CXE6 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Xrcc3Q9CXE6 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Xrcc3Q9CXE6 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Xrcc3Q9CXE6 4930463O16Rik-201ENSMUST00000020222 2088 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Xrcc3Q9CXE6 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Xrcc3Q9CXE6 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Xrcc3Q9CXE6 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Xrcc3Q9CXE6 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Xrcc3Q9CXE6 Triobp-204ENSMUST00000109690 7023 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Xrcc3Q9CXE6 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Xrcc3Q9CXE6 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Xrcc3Q9CXE6 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Xrcc3Q9CXE6 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Xrcc3Q9CXE6 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Xrcc3Q9CXE6 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Xrcc3Q9CXE6 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Xrcc3Q9CXE6 Ank1-204ENSMUST00000117270 5652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Xrcc3Q9CXE6 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 140.2 ms