Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTN4

Rhobtb3, Rho-related BTB domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhobtb3Q9CTN4 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rhobtb3Q9CTN4 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rhobtb3Q9CTN4 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rhobtb3Q9CTN4 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rhobtb3Q9CTN4 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rhobtb3Q9CTN4 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.9 ms