Protein–RNA interactions for Protein: Q99PE5

Smim3, Small integral membrane protein 3, mousemouse

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Length 60 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim3Q99PE5 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Car12-202ENSMUST00000085420 3639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Zmym3-209ENSMUST00000121520 5564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Shc1-210ENSMUST00000191485 3154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Nfkbiz-202ENSMUST00000096026 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Zbtb21-203ENSMUST00000113734 6010 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 4930463O16Rik-201ENSMUST00000020222 2088 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Caprin1-202ENSMUST00000111147 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Pla2g4c-201ENSMUST00000043612 3382 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Ppargc1b-201ENSMUST00000063307 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Igsf3-202ENSMUST00000195164 3876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Gm45234-201ENSMUST00000129411 4359 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Imp4-201ENSMUST00000027303 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Arhgef2-231ENSMUST00000177498 3966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Kcnab2-207ENSMUST00000160884 3922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Lamb1-205ENSMUST00000169088 5557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Esco1-201ENSMUST00000025142 4433 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Ncor2-202ENSMUST00000086083 8575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Nmt2-201ENSMUST00000081932 4461 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Inpp5j-201ENSMUST00000044507 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Ppp1r10-201ENSMUST00000087210 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Bace2-201ENSMUST00000047275 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Pip5k1a-205ENSMUST00000107233 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Zscan12-203ENSMUST00000225545 4405 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Nrip3-201ENSMUST00000033331 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Alox12-201ENSMUST00000000329 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.8 ms