Protein–RNA interactions for Protein: Q99N10

Ms4a8, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 8, mousemouse

Predictions only

Length 290 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a8Q99N10 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ms4a8Q99N10 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ms4a8Q99N10 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ms4a8Q99N10 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ms4a8Q99N10 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ms4a8Q99N10 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ms4a8Q99N10 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ms4a8Q99N10 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
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Ms4a8Q99N10 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ms4a8Q99N10 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ms4a8Q99N10 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ms4a8Q99N10 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ms4a8Q99N10 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ms4a8Q99N10 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ms4a8Q99N10 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ms4a8Q99N10 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
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Ms4a8Q99N10 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
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Ms4a8Q99N10 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ms4a8Q99N10 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ms4a8Q99N10 Gm14938-201ENSMUST00000119482 943 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Ms4a8Q99N10 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ms4a8Q99N10 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ms4a8Q99N10 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ms4a8Q99N10 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ms4a8Q99N10 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ms4a8Q99N10 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ms4a8Q99N10 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Ms4a8Q99N10 Gm3650-201ENSMUST00000180600 747 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Ms4a8Q99N10 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Ms4a8Q99N10 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ms4a8Q99N10 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ms4a8Q99N10 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ms4a8Q99N10 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ms4a8Q99N10 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Ms4a8Q99N10 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ms4a8Q99N10 4930557J02Rik-201ENSMUST00000202325 1075 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ms4a8Q99N10 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ms4a8Q99N10 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ms4a8Q99N10 Scoc-209ENSMUST00000212905 798 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ms4a8Q99N10 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
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Ms4a8Q99N10 Pinx1-201ENSMUST00000022528 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ms4a8Q99N10 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ms4a8Q99N10 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ms4a8Q99N10 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ms4a8Q99N10 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ms4a8Q99N10 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ms4a8Q99N10 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Ms4a8Q99N10 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ms4a8Q99N10 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
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Ms4a8Q99N10 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
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Ms4a8Q99N10 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
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Ms4a8Q99N10 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ms4a8Q99N10 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
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Ms4a8Q99N10 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Ms4a8Q99N10 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
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Ms4a8Q99N10 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Ms4a8Q99N10 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Ms4a8Q99N10 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Ms4a8Q99N10 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ms4a8Q99N10 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ms4a8Q99N10 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ms4a8Q99N10 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ms4a8Q99N10 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ms4a8Q99N10 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ms4a8Q99N10 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ms4a8Q99N10 Gm11980-201ENSMUST00000121445 986 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Ms4a8Q99N10 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ms4a8Q99N10 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ms4a8Q99N10 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ms4a8Q99N10 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Ms4a8Q99N10 Eloc-206ENSMUST00000186948 641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ms4a8Q99N10 Gm28721-201ENSMUST00000187649 918 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ms4a8Q99N10 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Ms4a8Q99N10 Gm42464-201ENSMUST00000196717 417 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Ms4a8Q99N10 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ms4a8Q99N10 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Ms4a8Q99N10 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Ms4a8Q99N10 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ms4a8Q99N10 4930447F04Rik-201ENSMUST00000033525 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ms4a8Q99N10 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ms4a8Q99N10 Clec2g-202ENSMUST00000075789 729 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ms4a8Q99N10 Tprkb-202ENSMUST00000089570 1216 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms