Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

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Length 1,454 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PtprtQ99M80 Gm8601-201ENSMUST00000182096 909 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PtprtQ99M80 Gm43564-201ENSMUST00000196185 211 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PtprtQ99M80 Gm32786-201ENSMUST00000211351 628 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PtprtQ99M80 AC153153.1-201ENSMUST00000225803 793 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
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PtprtQ99M80 Gm5072-201ENSMUST00000063726 1035 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PtprtQ99M80 Gm16477-201ENSMUST00000085365 801 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PtprtQ99M80 Gm5507-201ENSMUST00000091897 1008 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PtprtQ99M80 Gm17415-201ENSMUST00000096427 789 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PtprtQ99M80 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PtprtQ99M80 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PtprtQ99M80 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PtprtQ99M80 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PtprtQ99M80 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PtprtQ99M80 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PtprtQ99M80 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PtprtQ99M80 Adam20-201ENSMUST00000056331 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PtprtQ99M80 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PtprtQ99M80 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PtprtQ99M80 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PtprtQ99M80 Nudt13-203ENSMUST00000223663 1633 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
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PtprtQ99M80 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PtprtQ99M80 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
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PtprtQ99M80 Wfdc2-203ENSMUST00000109345 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PtprtQ99M80 Snx10-202ENSMUST00000114439 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PtprtQ99M80 1700064H15Rik-201ENSMUST00000119133 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PtprtQ99M80 Gm14227-201ENSMUST00000119431 629 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PtprtQ99M80 Gm37858-201ENSMUST00000192759 1231 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PtprtQ99M80 BB187690-201ENSMUST00000198619 1176 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PtprtQ99M80 Gm44917-201ENSMUST00000208798 520 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PtprtQ99M80 Gm45680-201ENSMUST00000211135 214 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PtprtQ99M80 Mt1-203ENSMUST00000212291 633 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PtprtQ99M80 Rps9-201ENSMUST00000006496 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PtprtQ99M80 Gm25580-201ENSMUST00000083409 327 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PtprtQ99M80 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
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PtprtQ99M80 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
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PtprtQ99M80 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PtprtQ99M80 Mpp1-202ENSMUST00000114091 1558 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PtprtQ99M80 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PtprtQ99M80 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
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PtprtQ99M80 4930593A02Rik-201ENSMUST00000181694 1437 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
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PtprtQ99M80 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PtprtQ99M80 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
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PtprtQ99M80 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
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PtprtQ99M80 Gm19605-205ENSMUST00000221712 677 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
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PtprtQ99M80 4921508M14Rik-201ENSMUST00000061679 1099 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
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PtprtQ99M80 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PtprtQ99M80 Gps2-202ENSMUST00000072581 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PtprtQ99M80 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PtprtQ99M80 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PtprtQ99M80 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PtprtQ99M80 Anxa3-205ENSMUST00000198631 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms