Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pacsin3Q99JB8 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pacsin3Q99JB8 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pacsin3Q99JB8 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pacsin3Q99JB8 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pacsin3Q99JB8 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pacsin3Q99JB8 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pacsin3Q99JB8 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pacsin3Q99JB8 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pacsin3Q99JB8 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pacsin3Q99JB8 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pacsin3Q99JB8 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pacsin3Q99JB8 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pacsin3Q99JB8 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Pacsin3Q99JB8 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pacsin3Q99JB8 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pacsin3Q99JB8 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pacsin3Q99JB8 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pacsin3Q99JB8 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pacsin3Q99JB8 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Pacsin3Q99JB8 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Pacsin3Q99JB8 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pacsin3Q99JB8 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pacsin3Q99JB8 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Pacsin3Q99JB8 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pacsin3Q99JB8 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pacsin3Q99JB8 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pacsin3Q99JB8 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pacsin3Q99JB8 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pacsin3Q99JB8 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pacsin3Q99JB8 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Pacsin3Q99JB8 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pacsin3Q99JB8 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pacsin3Q99JB8 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pacsin3Q99JB8 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pacsin3Q99JB8 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pacsin3Q99JB8 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pacsin3Q99JB8 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pacsin3Q99JB8 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pacsin3Q99JB8 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pacsin3Q99JB8 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pacsin3Q99JB8 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pacsin3Q99JB8 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pacsin3Q99JB8 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pacsin3Q99JB8 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pacsin3Q99JB8 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pacsin3Q99JB8 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pacsin3Q99JB8 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pacsin3Q99JB8 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pacsin3Q99JB8 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Pacsin3Q99JB8 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pacsin3Q99JB8 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pacsin3Q99JB8 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pacsin3Q99JB8 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pacsin3Q99JB8 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pacsin3Q99JB8 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pacsin3Q99JB8 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pacsin3Q99JB8 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pacsin3Q99JB8 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pacsin3Q99JB8 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Pacsin3Q99JB8 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Pacsin3Q99JB8 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pacsin3Q99JB8 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Pacsin3Q99JB8 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Pacsin3Q99JB8 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Pacsin3Q99JB8 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pacsin3Q99JB8 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pacsin3Q99JB8 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pacsin3Q99JB8 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pacsin3Q99JB8 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pacsin3Q99JB8 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Pacsin3Q99JB8 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pacsin3Q99JB8 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pacsin3Q99JB8 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Pacsin3Q99JB8 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pacsin3Q99JB8 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pacsin3Q99JB8 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pacsin3Q99JB8 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pacsin3Q99JB8 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pacsin3Q99JB8 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pacsin3Q99JB8 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pacsin3Q99JB8 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pacsin3Q99JB8 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pacsin3Q99JB8 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Pacsin3Q99JB8 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pacsin3Q99JB8 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pacsin3Q99JB8 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pacsin3Q99JB8 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pacsin3Q99JB8 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pacsin3Q99JB8 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pacsin3Q99JB8 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pacsin3Q99JB8 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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