Protein–RNA interactions for Protein: Q99J19

Smim11a, Small integral membrane protein 11A, mousemouse

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Length 55 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim11aQ99J19 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Smim11aQ99J19 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Smim11aQ99J19 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Smim11aQ99J19 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Smim11aQ99J19 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Smim11aQ99J19 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Smim11aQ99J19 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Smim11aQ99J19 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Smim11aQ99J19 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Smim11aQ99J19 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Smim11aQ99J19 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Smim11aQ99J19 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Smim11aQ99J19 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Smim11aQ99J19 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Smim11aQ99J19 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Smim11aQ99J19 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Smim11aQ99J19 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Smim11aQ99J19 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Smim11aQ99J19 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Smim11aQ99J19 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Smim11aQ99J19 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Smim11aQ99J19 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Smim11aQ99J19 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Smim11aQ99J19 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Smim11aQ99J19 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Smim11aQ99J19 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Smim11aQ99J19 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Smim11aQ99J19 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Smim11aQ99J19 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Smim11aQ99J19 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Smim11aQ99J19 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Smim11aQ99J19 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Smim11aQ99J19 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Smim11aQ99J19 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Smim11aQ99J19 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Smim11aQ99J19 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Smim11aQ99J19 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Smim11aQ99J19 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Smim11aQ99J19 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Smim11aQ99J19 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Smim11aQ99J19 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Smim11aQ99J19 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Smim11aQ99J19 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Smim11aQ99J19 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Smim11aQ99J19 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Smim11aQ99J19 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Smim11aQ99J19 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Smim11aQ99J19 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Smim11aQ99J19 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Smim11aQ99J19 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Smim11aQ99J19 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Smim11aQ99J19 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Smim11aQ99J19 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Smim11aQ99J19 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Smim11aQ99J19 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Smim11aQ99J19 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Smim11aQ99J19 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Smim11aQ99J19 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Smim11aQ99J19 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Smim11aQ99J19 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Smim11aQ99J19 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Smim11aQ99J19 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Smim11aQ99J19 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Smim11aQ99J19 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Smim11aQ99J19 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Smim11aQ99J19 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Smim11aQ99J19 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Smim11aQ99J19 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Smim11aQ99J19 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Smim11aQ99J19 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Smim11aQ99J19 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Smim11aQ99J19 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Smim11aQ99J19 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Smim11aQ99J19 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Smim11aQ99J19 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Smim11aQ99J19 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Smim11aQ99J19 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Smim11aQ99J19 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Smim11aQ99J19 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Smim11aQ99J19 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Smim11aQ99J19 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Smim11aQ99J19 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Smim11aQ99J19 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Smim11aQ99J19 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Smim11aQ99J19 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Smim11aQ99J19 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Smim11aQ99J19 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Smim11aQ99J19 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Smim11aQ99J19 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Smim11aQ99J19 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Smim11aQ99J19 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Smim11aQ99J19 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Smim11aQ99J19 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Smim11aQ99J19 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Smim11aQ99J19 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Smim11aQ99J19 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Smim11aQ99J19 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Smim11aQ99J19 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Smim11aQ99J19 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Smim11aQ99J19 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
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