Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE97

Srsf4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 489 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf4Q8VE97 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Srsf4Q8VE97 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Srsf4Q8VE97 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Srsf4Q8VE97 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Srsf4Q8VE97 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Srsf4Q8VE97 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Srsf4Q8VE97 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Srsf4Q8VE97 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Srsf4Q8VE97 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Srsf4Q8VE97 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Srsf4Q8VE97 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Srsf4Q8VE97 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Srsf4Q8VE97 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Srsf4Q8VE97 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Srsf4Q8VE97 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Srsf4Q8VE97 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Srsf4Q8VE97 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Srsf4Q8VE97 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Srsf4Q8VE97 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Srsf4Q8VE97 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Srsf4Q8VE97 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Srsf4Q8VE97 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Srsf4Q8VE97 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Srsf4Q8VE97 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Srsf4Q8VE97 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Srsf4Q8VE97 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Srsf4Q8VE97 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Srsf4Q8VE97 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Srsf4Q8VE97 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Srsf4Q8VE97 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Srsf4Q8VE97 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Srsf4Q8VE97 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Srsf4Q8VE97 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Srsf4Q8VE97 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Srsf4Q8VE97 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Srsf4Q8VE97 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Srsf4Q8VE97 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Srsf4Q8VE97 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Srsf4Q8VE97 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Srsf4Q8VE97 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Srsf4Q8VE97 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Srsf4Q8VE97 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Srsf4Q8VE97 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Srsf4Q8VE97 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Srsf4Q8VE97 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Srsf4Q8VE97 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Srsf4Q8VE97 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Srsf4Q8VE97 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Srsf4Q8VE97 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Srsf4Q8VE97 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Srsf4Q8VE97 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Srsf4Q8VE97 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Srsf4Q8VE97 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Srsf4Q8VE97 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Srsf4Q8VE97 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Srsf4Q8VE97 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Srsf4Q8VE97 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Srsf4Q8VE97 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Srsf4Q8VE97 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Srsf4Q8VE97 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Srsf4Q8VE97 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Srsf4Q8VE97 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Srsf4Q8VE97 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Srsf4Q8VE97 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Srsf4Q8VE97 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Srsf4Q8VE97 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Srsf4Q8VE97 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Srsf4Q8VE97 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Srsf4Q8VE97 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Srsf4Q8VE97 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Srsf4Q8VE97 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Srsf4Q8VE97 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Srsf4Q8VE97 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Srsf4Q8VE97 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Srsf4Q8VE97 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Srsf4Q8VE97 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Srsf4Q8VE97 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Srsf4Q8VE97 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Srsf4Q8VE97 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Srsf4Q8VE97 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Srsf4Q8VE97 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Srsf4Q8VE97 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Srsf4Q8VE97 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Srsf4Q8VE97 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Srsf4Q8VE97 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Srsf4Q8VE97 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Srsf4Q8VE97 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Srsf4Q8VE97 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Srsf4Q8VE97 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Srsf4Q8VE97 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Srsf4Q8VE97 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Srsf4Q8VE97 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Srsf4Q8VE97 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Srsf4Q8VE97 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Srsf4Q8VE97 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Srsf4Q8VE97 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Srsf4Q8VE97 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Srsf4Q8VE97 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Srsf4Q8VE97 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Srsf4Q8VE97 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 130.3 ms