Protein–RNA interactions for Protein: Q8K099

Lrit1, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 624 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrit1Q8K099 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Lrit1Q8K099 Gm11981-201ENSMUST00000139769 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lrit1Q8K099 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lrit1Q8K099 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Lrit1Q8K099 4931440J10Rik-201ENSMUST00000181344 891 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lrit1Q8K099 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lrit1Q8K099 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
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Lrit1Q8K099 Timm9-210ENSMUST00000221892 734 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lrit1Q8K099 AC121357.1-201ENSMUST00000227365 608 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
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Lrit1Q8K099 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lrit1Q8K099 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Lrit1Q8K099 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Lrit1Q8K099 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lrit1Q8K099 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lrit1Q8K099 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lrit1Q8K099 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lrit1Q8K099 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Lrit1Q8K099 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Lrit1Q8K099 Cma1-201ENSMUST00000022834 1074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lrit1Q8K099 Ifitm1-201ENSMUST00000026564 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Lrit1Q8K099 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Lrit1Q8K099 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Lrit1Q8K099 4933402C05Rik-201ENSMUST00000208189 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Lrit1Q8K099 BC049987-201ENSMUST00000213859 918 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lrit1Q8K099 AC134248.1-201ENSMUST00000216113 1176 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Lrit1Q8K099 Nkain2-205ENSMUST00000219125 1166 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Lrit1Q8K099 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lrit1Q8K099 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lrit1Q8K099 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lrit1Q8K099 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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