Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ78

Znf628, Zinc finger protein 628, mousemouse

Predictions only

Length 1,038 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf628Q8CJ78 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Znf628Q8CJ78 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Znf628Q8CJ78 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Znf628Q8CJ78 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Znf628Q8CJ78 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Znf628Q8CJ78 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Znf628Q8CJ78 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Znf628Q8CJ78 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Znf628Q8CJ78 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Znf628Q8CJ78 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Znf628Q8CJ78 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Znf628Q8CJ78 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Znf628Q8CJ78 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Znf628Q8CJ78 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Znf628Q8CJ78 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Znf628Q8CJ78 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Znf628Q8CJ78 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Znf628Q8CJ78 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Znf628Q8CJ78 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Znf628Q8CJ78 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Znf628Q8CJ78 Bbs5-202ENSMUST00000112286 1397 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Znf628Q8CJ78 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Znf628Q8CJ78 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Znf628Q8CJ78 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Znf628Q8CJ78 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Znf628Q8CJ78 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Znf628Q8CJ78 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Znf628Q8CJ78 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Znf628Q8CJ78 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Znf628Q8CJ78 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Znf628Q8CJ78 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Znf628Q8CJ78 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Znf628Q8CJ78 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Znf628Q8CJ78 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Znf628Q8CJ78 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Znf628Q8CJ78 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Znf628Q8CJ78 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Znf628Q8CJ78 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Znf628Q8CJ78 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Znf628Q8CJ78 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Znf628Q8CJ78 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Znf628Q8CJ78 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Znf628Q8CJ78 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Znf628Q8CJ78 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Znf628Q8CJ78 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Znf628Q8CJ78 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Znf628Q8CJ78 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Znf628Q8CJ78 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Znf628Q8CJ78 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Znf628Q8CJ78 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Znf628Q8CJ78 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Znf628Q8CJ78 Gm8365-201ENSMUST00000197334 648 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Znf628Q8CJ78 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Znf628Q8CJ78 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Znf628Q8CJ78 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Znf628Q8CJ78 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Znf628Q8CJ78 Gm29676-202ENSMUST00000222409 364 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Znf628Q8CJ78 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Znf628Q8CJ78 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Znf628Q8CJ78 Tff2-201ENSMUST00000024826 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Znf628Q8CJ78 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Znf628Q8CJ78 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Znf628Q8CJ78 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Znf628Q8CJ78 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Znf628Q8CJ78 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Znf628Q8CJ78 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Znf628Q8CJ78 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Znf628Q8CJ78 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Znf628Q8CJ78 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Znf628Q8CJ78 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Znf628Q8CJ78 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Znf628Q8CJ78 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Znf628Q8CJ78 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Znf628Q8CJ78 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Znf628Q8CJ78 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Znf628Q8CJ78 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Znf628Q8CJ78 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Znf628Q8CJ78 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Znf628Q8CJ78 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Znf628Q8CJ78 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Znf628Q8CJ78 Crhr2-204ENSMUST00000164012 1263 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Znf628Q8CJ78 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Znf628Q8CJ78 Gm9463-201ENSMUST00000206707 601 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Znf628Q8CJ78 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Znf628Q8CJ78 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Znf628Q8CJ78 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Znf628Q8CJ78 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Znf628Q8CJ78 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Znf628Q8CJ78 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Znf628Q8CJ78 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Znf628Q8CJ78 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Znf628Q8CJ78 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Znf628Q8CJ78 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Znf628Q8CJ78 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Znf628Q8CJ78 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Znf628Q8CJ78 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Znf628Q8CJ78 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Znf628Q8CJ78 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Znf628Q8CJ78 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Znf628Q8CJ78 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms