Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIX8

Lgsn, Lengsin, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LgsnQ8CIX8 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LgsnQ8CIX8 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
LgsnQ8CIX8 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LgsnQ8CIX8 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LgsnQ8CIX8 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
LgsnQ8CIX8 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
LgsnQ8CIX8 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
LgsnQ8CIX8 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LgsnQ8CIX8 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LgsnQ8CIX8 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
LgsnQ8CIX8 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LgsnQ8CIX8 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
LgsnQ8CIX8 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
LgsnQ8CIX8 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LgsnQ8CIX8 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LgsnQ8CIX8 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LgsnQ8CIX8 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LgsnQ8CIX8 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
LgsnQ8CIX8 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LgsnQ8CIX8 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LgsnQ8CIX8 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LgsnQ8CIX8 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LgsnQ8CIX8 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LgsnQ8CIX8 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LgsnQ8CIX8 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LgsnQ8CIX8 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
LgsnQ8CIX8 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LgsnQ8CIX8 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
LgsnQ8CIX8 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
LgsnQ8CIX8 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LgsnQ8CIX8 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LgsnQ8CIX8 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LgsnQ8CIX8 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LgsnQ8CIX8 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LgsnQ8CIX8 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LgsnQ8CIX8 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LgsnQ8CIX8 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LgsnQ8CIX8 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LgsnQ8CIX8 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
LgsnQ8CIX8 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LgsnQ8CIX8 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LgsnQ8CIX8 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LgsnQ8CIX8 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LgsnQ8CIX8 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
LgsnQ8CIX8 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
LgsnQ8CIX8 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LgsnQ8CIX8 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
LgsnQ8CIX8 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
LgsnQ8CIX8 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LgsnQ8CIX8 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
LgsnQ8CIX8 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LgsnQ8CIX8 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
LgsnQ8CIX8 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
LgsnQ8CIX8 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
LgsnQ8CIX8 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
LgsnQ8CIX8 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LgsnQ8CIX8 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LgsnQ8CIX8 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
LgsnQ8CIX8 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LgsnQ8CIX8 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LgsnQ8CIX8 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LgsnQ8CIX8 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
LgsnQ8CIX8 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
LgsnQ8CIX8 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
LgsnQ8CIX8 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
LgsnQ8CIX8 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
LgsnQ8CIX8 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
LgsnQ8CIX8 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
LgsnQ8CIX8 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
LgsnQ8CIX8 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
LgsnQ8CIX8 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
LgsnQ8CIX8 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
LgsnQ8CIX8 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
LgsnQ8CIX8 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
LgsnQ8CIX8 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LgsnQ8CIX8 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
LgsnQ8CIX8 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LgsnQ8CIX8 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LgsnQ8CIX8 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
LgsnQ8CIX8 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
LgsnQ8CIX8 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LgsnQ8CIX8 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LgsnQ8CIX8 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LgsnQ8CIX8 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LgsnQ8CIX8 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LgsnQ8CIX8 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LgsnQ8CIX8 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
LgsnQ8CIX8 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LgsnQ8CIX8 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
LgsnQ8CIX8 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
LgsnQ8CIX8 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
LgsnQ8CIX8 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
LgsnQ8CIX8 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
LgsnQ8CIX8 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
LgsnQ8CIX8 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
LgsnQ8CIX8 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
LgsnQ8CIX8 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
LgsnQ8CIX8 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LgsnQ8CIX8 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
LgsnQ8CIX8 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms