Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDD9

Lrif1, Ligand-dependent nuclear receptor-interacting factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 755 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrif1Q8CDD9 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lrif1Q8CDD9 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lrif1Q8CDD9 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Lrif1Q8CDD9 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lrif1Q8CDD9 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lrif1Q8CDD9 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lrif1Q8CDD9 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lrif1Q8CDD9 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lrif1Q8CDD9 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lrif1Q8CDD9 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lrif1Q8CDD9 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lrif1Q8CDD9 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lrif1Q8CDD9 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Lrif1Q8CDD9 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lrif1Q8CDD9 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lrif1Q8CDD9 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lrif1Q8CDD9 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lrif1Q8CDD9 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Lrif1Q8CDD9 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lrif1Q8CDD9 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lrif1Q8CDD9 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Lrif1Q8CDD9 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lrif1Q8CDD9 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lrif1Q8CDD9 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lrif1Q8CDD9 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Lrif1Q8CDD9 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lrif1Q8CDD9 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lrif1Q8CDD9 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lrif1Q8CDD9 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lrif1Q8CDD9 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lrif1Q8CDD9 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Lrif1Q8CDD9 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lrif1Q8CDD9 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lrif1Q8CDD9 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lrif1Q8CDD9 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lrif1Q8CDD9 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lrif1Q8CDD9 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Lrif1Q8CDD9 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lrif1Q8CDD9 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lrif1Q8CDD9 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lrif1Q8CDD9 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lrif1Q8CDD9 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Lrif1Q8CDD9 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lrif1Q8CDD9 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lrif1Q8CDD9 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lrif1Q8CDD9 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Lrif1Q8CDD9 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Lrif1Q8CDD9 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Lrif1Q8CDD9 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Lrif1Q8CDD9 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lrif1Q8CDD9 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lrif1Q8CDD9 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lrif1Q8CDD9 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lrif1Q8CDD9 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lrif1Q8CDD9 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lrif1Q8CDD9 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lrif1Q8CDD9 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lrif1Q8CDD9 Tbc1d14-202ENSMUST00000124036 2765 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lrif1Q8CDD9 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lrif1Q8CDD9 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Lrif1Q8CDD9 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lrif1Q8CDD9 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lrif1Q8CDD9 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Lrif1Q8CDD9 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lrif1Q8CDD9 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lrif1Q8CDD9 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lrif1Q8CDD9 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lrif1Q8CDD9 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lrif1Q8CDD9 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lrif1Q8CDD9 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Lrif1Q8CDD9 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lrif1Q8CDD9 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lrif1Q8CDD9 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lrif1Q8CDD9 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lrif1Q8CDD9 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lrif1Q8CDD9 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lrif1Q8CDD9 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lrif1Q8CDD9 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lrif1Q8CDD9 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lrif1Q8CDD9 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lrif1Q8CDD9 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lrif1Q8CDD9 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lrif1Q8CDD9 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Lrif1Q8CDD9 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lrif1Q8CDD9 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lrif1Q8CDD9 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Lrif1Q8CDD9 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lrif1Q8CDD9 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lrif1Q8CDD9 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lrif1Q8CDD9 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lrif1Q8CDD9 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lrif1Q8CDD9 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lrif1Q8CDD9 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Lrif1Q8CDD9 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Lrif1Q8CDD9 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lrif1Q8CDD9 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lrif1Q8CDD9 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lrif1Q8CDD9 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lrif1Q8CDD9 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lrif1Q8CDD9 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms