Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVL3

Snx17, Sorting nexin-17, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx17Q8BVL3 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snx17Q8BVL3 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snx17Q8BVL3 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snx17Q8BVL3 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snx17Q8BVL3 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snx17Q8BVL3 Brd4-202ENSMUST00000114475 2731 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Snx17Q8BVL3 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Snx17Q8BVL3 Rtbdn-202ENSMUST00000109740 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Snx17Q8BVL3 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Snx17Q8BVL3 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Snx17Q8BVL3 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Snx17Q8BVL3 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Snx17Q8BVL3 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Snx17Q8BVL3 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Snx17Q8BVL3 Fam3a-201ENSMUST00000015427 1427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Snx17Q8BVL3 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Snx17Q8BVL3 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Snx17Q8BVL3 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Snx17Q8BVL3 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Snx17Q8BVL3 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Snx17Q8BVL3 Krtap4-9-201ENSMUST00000105059 1059 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Snx17Q8BVL3 Gng12-205ENSMUST00000114226 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Snx17Q8BVL3 Tbata-203ENSMUST00000121297 1000 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Snx17Q8BVL3 Marcksl1-ps4-201ENSMUST00000132531 291 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Snx17Q8BVL3 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Snx17Q8BVL3 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Snx17Q8BVL3 Iqcf3-202ENSMUST00000186668 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Snx17Q8BVL3 Gm7596-202ENSMUST00000202171 737 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Snx17Q8BVL3 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Snx17Q8BVL3 Gm7972-202ENSMUST00000208453 505 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Snx17Q8BVL3 Gm45500-201ENSMUST00000211676 803 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Snx17Q8BVL3 Mt1-202ENSMUST00000211807 1085 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Snx17Q8BVL3 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Snx17Q8BVL3 Spdye4a-203ENSMUST00000195900 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Snx17Q8BVL3 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Snx17Q8BVL3 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Snx17Q8BVL3 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Snx17Q8BVL3 2610301B20Rik-202ENSMUST00000101504 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Snx17Q8BVL3 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Snx17Q8BVL3 Rnf133-202ENSMUST00000115354 1333 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Snx17Q8BVL3 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Snx17Q8BVL3 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Snx17Q8BVL3 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Snx17Q8BVL3 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Snx17Q8BVL3 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Snx17Q8BVL3 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Snx17Q8BVL3 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Snx17Q8BVL3 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Snx17Q8BVL3 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Snx17Q8BVL3 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Snx17Q8BVL3 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Snx17Q8BVL3 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Snx17Q8BVL3 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Snx17Q8BVL3 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Snx17Q8BVL3 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Snx17Q8BVL3 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Snx17Q8BVL3 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Snx17Q8BVL3 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Snx17Q8BVL3 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Snx17Q8BVL3 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Snx17Q8BVL3 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Snx17Q8BVL3 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Snx17Q8BVL3 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Snx17Q8BVL3 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Snx17Q8BVL3 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Snx17Q8BVL3 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Snx17Q8BVL3 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Snx17Q8BVL3 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Snx17Q8BVL3 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Snx17Q8BVL3 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Snx17Q8BVL3 Rhox3d-ps-201ENSMUST00000119181 825 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Snx17Q8BVL3 n-R5s84-201ENSMUST00000122591 109 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Snx17Q8BVL3 Gm15409-201ENSMUST00000135240 520 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Snx17Q8BVL3 Rpl9-ps7-201ENSMUST00000140507 579 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Snx17Q8BVL3 Zfp667-204ENSMUST00000153840 596 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Snx17Q8BVL3 Gm20536-201ENSMUST00000172588 406 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Snx17Q8BVL3 Gm42779-201ENSMUST00000198807 406 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Snx17Q8BVL3 Znhit6-206ENSMUST00000199033 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Snx17Q8BVL3 Mpv17-206ENSMUST00000201353 846 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Snx17Q8BVL3 Gm45410-201ENSMUST00000211331 1093 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Snx17Q8BVL3 Rasl11a-201ENSMUST00000031646 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Snx17Q8BVL3 1700001K19Rik-201ENSMUST00000070659 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Snx17Q8BVL3 Rpl9-ps4-201ENSMUST00000075549 579 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Snx17Q8BVL3 Gm5451-201ENSMUST00000080545 579 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Snx17Q8BVL3 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Snx17Q8BVL3 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Snx17Q8BVL3 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Snx17Q8BVL3 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Snx17Q8BVL3 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Snx17Q8BVL3 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Snx17Q8BVL3 Chac2-202ENSMUST00000101394 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Snx17Q8BVL3 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Snx17Q8BVL3 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Snx17Q8BVL3 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Snx17Q8BVL3 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Snx17Q8BVL3 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Snx17Q8BVL3 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Snx17Q8BVL3 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Snx17Q8BVL3 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Snx17Q8BVL3 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
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