Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF2

Pdcl3, Phosducin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcl3Q8BVF2 Gm29222-201ENSMUST00000185442 2167 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pdcl3Q8BVF2 Gm29449-201ENSMUST00000187820 2168 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pdcl3Q8BVF2 Gm28104-201ENSMUST00000188331 2168 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pdcl3Q8BVF2 Gm28743-201ENSMUST00000189014 2168 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pdcl3Q8BVF2 Gm29384-201ENSMUST00000190852 2168 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pdcl3Q8BVF2 Gm37538-201ENSMUST00000192417 2168 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pdcl3Q8BVF2 BC049352-203ENSMUST00000171799 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pdcl3Q8BVF2 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Pdcl3Q8BVF2 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pdcl3Q8BVF2 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pdcl3Q8BVF2 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Pdcl3Q8BVF2 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pdcl3Q8BVF2 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pdcl3Q8BVF2 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pdcl3Q8BVF2 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Pdcl3Q8BVF2 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
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Pdcl3Q8BVF2 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pdcl3Q8BVF2 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Pdcl3Q8BVF2 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pdcl3Q8BVF2 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Pdcl3Q8BVF2 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pdcl3Q8BVF2 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pdcl3Q8BVF2 Txk-201ENSMUST00000113604 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pdcl3Q8BVF2 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pdcl3Q8BVF2 Zfp775-201ENSMUST00000061720 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Pdcl3Q8BVF2 Chdh-202ENSMUST00000118917 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Pdcl3Q8BVF2 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Pdcl3Q8BVF2 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Pdcl3Q8BVF2 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Pdcl3Q8BVF2 Lingo1-201ENSMUST00000053568 3295 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pdcl3Q8BVF2 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Pdcl3Q8BVF2 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pdcl3Q8BVF2 Fam26e-201ENSMUST00000069125 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Pdcl3Q8BVF2 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pdcl3Q8BVF2 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pdcl3Q8BVF2 Tmem184a-202ENSMUST00000110832 4326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pdcl3Q8BVF2 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pdcl3Q8BVF2 Kirrel3-201ENSMUST00000045091 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Pdcl3Q8BVF2 Lrpap1-201ENSMUST00000030986 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Pdcl3Q8BVF2 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Pdcl3Q8BVF2 Exoc4-202ENSMUST00000090381 2598 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Pdcl3Q8BVF2 Platr4-203ENSMUST00000199155 2161 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pdcl3Q8BVF2 Bbs2-201ENSMUST00000034206 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Pdcl3Q8BVF2 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Pdcl3Q8BVF2 Slc17a5-201ENSMUST00000052441 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Pdcl3Q8BVF2 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pdcl3Q8BVF2 Gm37451-201ENSMUST00000194718 2167 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pdcl3Q8BVF2 Thbs4-201ENSMUST00000022213 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pdcl3Q8BVF2 Qtrt2-201ENSMUST00000023387 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pdcl3Q8BVF2 Ablim2-204ENSMUST00000114204 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pdcl3Q8BVF2 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pdcl3Q8BVF2 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pdcl3Q8BVF2 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pdcl3Q8BVF2 Rnh1-201ENSMUST00000106033 2091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pdcl3Q8BVF2 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pdcl3Q8BVF2 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pdcl3Q8BVF2 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pdcl3Q8BVF2 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pdcl3Q8BVF2 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Pdcl3Q8BVF2 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pdcl3Q8BVF2 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pdcl3Q8BVF2 Ptbp1-206ENSMUST00000165704 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pdcl3Q8BVF2 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pdcl3Q8BVF2 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pdcl3Q8BVF2 Sap30bpos-201ENSMUST00000132264 2352 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pdcl3Q8BVF2 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pdcl3Q8BVF2 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pdcl3Q8BVF2 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pdcl3Q8BVF2 Pa2g4-202ENSMUST00000131728 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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