Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSN2

Clm, CMRF35-like molecule, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClmQ7TSN2 AC142113.2-201ENSMUST00000217425 748 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
ClmQ7TSN2 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
ClmQ7TSN2 AC158631.2-201ENSMUST00000219999 478 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
ClmQ7TSN2 CT010575.2-201ENSMUST00000222876 496 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
ClmQ7TSN2 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
ClmQ7TSN2 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
ClmQ7TSN2 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
ClmQ7TSN2 Vmn1r210-201ENSMUST00000072044 921 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
ClmQ7TSN2 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
ClmQ7TSN2 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
ClmQ7TSN2 Raet1d-201ENSMUST00000095795 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
ClmQ7TSN2 Olfr1163-201ENSMUST00000099835 1043 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
ClmQ7TSN2 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
ClmQ7TSN2 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
ClmQ7TSN2 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
ClmQ7TSN2 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
ClmQ7TSN2 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
ClmQ7TSN2 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
ClmQ7TSN2 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
ClmQ7TSN2 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
ClmQ7TSN2 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
ClmQ7TSN2 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
ClmQ7TSN2 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
ClmQ7TSN2 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
ClmQ7TSN2 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
ClmQ7TSN2 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
ClmQ7TSN2 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
ClmQ7TSN2 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
ClmQ7TSN2 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
ClmQ7TSN2 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
ClmQ7TSN2 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
ClmQ7TSN2 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
ClmQ7TSN2 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
ClmQ7TSN2 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
ClmQ7TSN2 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
ClmQ7TSN2 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
ClmQ7TSN2 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
ClmQ7TSN2 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
ClmQ7TSN2 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
ClmQ7TSN2 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
ClmQ7TSN2 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
ClmQ7TSN2 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
ClmQ7TSN2 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
ClmQ7TSN2 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
ClmQ7TSN2 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
ClmQ7TSN2 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
ClmQ7TSN2 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
ClmQ7TSN2 Sertm1-202ENSMUST00000162201 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
ClmQ7TSN2 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
ClmQ7TSN2 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
ClmQ7TSN2 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
ClmQ7TSN2 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
ClmQ7TSN2 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
ClmQ7TSN2 Gm15258-201ENSMUST00000153801 741 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
ClmQ7TSN2 Gm22552-201ENSMUST00000157796 337 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
ClmQ7TSN2 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
ClmQ7TSN2 Gm17219-201ENSMUST00000168439 593 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
ClmQ7TSN2 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
ClmQ7TSN2 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
ClmQ7TSN2 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
ClmQ7TSN2 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
ClmQ7TSN2 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
ClmQ7TSN2 Gm37337-201ENSMUST00000192601 993 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
ClmQ7TSN2 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
ClmQ7TSN2 Gm8869-201ENSMUST00000195222 947 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
ClmQ7TSN2 Vmn1r-ps6-201ENSMUST00000201079 934 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
ClmQ7TSN2 Znrd1as-204ENSMUST00000209623 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
ClmQ7TSN2 1700047O18Rik-201ENSMUST00000209738 743 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
ClmQ7TSN2 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
ClmQ7TSN2 Gm46436-201ENSMUST00000221851 1294 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
ClmQ7TSN2 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
ClmQ7TSN2 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
ClmQ7TSN2 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
ClmQ7TSN2 Raet1e-201ENSMUST00000065527 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
ClmQ7TSN2 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
ClmQ7TSN2 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
ClmQ7TSN2 Olfr725-201ENSMUST00000089844 1110 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
ClmQ7TSN2 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
ClmQ7TSN2 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
ClmQ7TSN2 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
ClmQ7TSN2 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
ClmQ7TSN2 Gm10388-201ENSMUST00000205001 2936 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
ClmQ7TSN2 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
ClmQ7TSN2 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
ClmQ7TSN2 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
ClmQ7TSN2 Gm26670-201ENSMUST00000180429 3287 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
ClmQ7TSN2 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
ClmQ7TSN2 Ccdc7a-202ENSMUST00000108747 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
ClmQ7TSN2 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
ClmQ7TSN2 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
ClmQ7TSN2 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
ClmQ7TSN2 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
ClmQ7TSN2 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
ClmQ7TSN2 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
ClmQ7TSN2 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
ClmQ7TSN2 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
ClmQ7TSN2 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
ClmQ7TSN2 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
ClmQ7TSN2 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
ClmQ7TSN2 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73 ms