Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWS4

Cnih3, Protein cornichon homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih3Q6ZWS4 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cnih3Q6ZWS4 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cnih3Q6ZWS4 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cnih3Q6ZWS4 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Cnih3Q6ZWS4 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Cnih3Q6ZWS4 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cnih3Q6ZWS4 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cnih3Q6ZWS4 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cnih3Q6ZWS4 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cnih3Q6ZWS4 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Cnih3Q6ZWS4 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cnih3Q6ZWS4 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cnih3Q6ZWS4 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cnih3Q6ZWS4 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cnih3Q6ZWS4 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cnih3Q6ZWS4 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cnih3Q6ZWS4 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cnih3Q6ZWS4 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cnih3Q6ZWS4 Srsf6-203ENSMUST00000130411 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cnih3Q6ZWS4 Slc2a10-201ENSMUST00000029196 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cnih3Q6ZWS4 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cnih3Q6ZWS4 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Cnih3Q6ZWS4 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cnih3Q6ZWS4 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cnih3Q6ZWS4 Nap1l3-201ENSMUST00000079490 2837 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cnih3Q6ZWS4 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cnih3Q6ZWS4 Plekhg4-203ENSMUST00000160191 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cnih3Q6ZWS4 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cnih3Q6ZWS4 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cnih3Q6ZWS4 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cnih3Q6ZWS4 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Cnih3Q6ZWS4 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cnih3Q6ZWS4 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cnih3Q6ZWS4 Ablim1-213ENSMUST00000111559 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cnih3Q6ZWS4 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Cnih3Q6ZWS4 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Cnih3Q6ZWS4 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cnih3Q6ZWS4 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cnih3Q6ZWS4 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cnih3Q6ZWS4 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cnih3Q6ZWS4 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cnih3Q6ZWS4 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cnih3Q6ZWS4 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cnih3Q6ZWS4 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cnih3Q6ZWS4 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cnih3Q6ZWS4 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cnih3Q6ZWS4 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cnih3Q6ZWS4 4930463O16Rik-201ENSMUST00000020222 2088 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cnih3Q6ZWS4 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cnih3Q6ZWS4 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Cnih3Q6ZWS4 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cnih3Q6ZWS4 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cnih3Q6ZWS4 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cnih3Q6ZWS4 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cnih3Q6ZWS4 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cnih3Q6ZWS4 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Cnih3Q6ZWS4 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cnih3Q6ZWS4 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cnih3Q6ZWS4 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cnih3Q6ZWS4 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cnih3Q6ZWS4 Rasgrp4-210ENSMUST00000203070 3008 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cnih3Q6ZWS4 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cnih3Q6ZWS4 Rgs12-203ENSMUST00000114280 2777 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cnih3Q6ZWS4 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cnih3Q6ZWS4 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cnih3Q6ZWS4 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cnih3Q6ZWS4 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cnih3Q6ZWS4 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cnih3Q6ZWS4 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cnih3Q6ZWS4 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cnih3Q6ZWS4 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cnih3Q6ZWS4 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cnih3Q6ZWS4 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Cnih3Q6ZWS4 Gm10548-201ENSMUST00000097631 2629 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Cnih3Q6ZWS4 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cnih3Q6ZWS4 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cnih3Q6ZWS4 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cnih3Q6ZWS4 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cnih3Q6ZWS4 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cnih3Q6ZWS4 Tspan18-202ENSMUST00000111265 3751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Cnih3Q6ZWS4 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cnih3Q6ZWS4 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cnih3Q6ZWS4 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cnih3Q6ZWS4 Slc22a14-201ENSMUST00000093775 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cnih3Q6ZWS4 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cnih3Q6ZWS4 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cnih3Q6ZWS4 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cnih3Q6ZWS4 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cnih3Q6ZWS4 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cnih3Q6ZWS4 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Cnih3Q6ZWS4 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cnih3Q6ZWS4 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cnih3Q6ZWS4 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Cnih3Q6ZWS4 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Cnih3Q6ZWS4 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cnih3Q6ZWS4 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cnih3Q6ZWS4 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Cnih3Q6ZWS4 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cnih3Q6ZWS4 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cnih3Q6ZWS4 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms