Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPL0

Sec31a, Protein transport protein Sec31A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec31aQ3UPL0 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sec31aQ3UPL0 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sec31aQ3UPL0 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sec31aQ3UPL0 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sec31aQ3UPL0 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sec31aQ3UPL0 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Sec31aQ3UPL0 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sec31aQ3UPL0 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sec31aQ3UPL0 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sec31aQ3UPL0 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sec31aQ3UPL0 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sec31aQ3UPL0 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sec31aQ3UPL0 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sec31aQ3UPL0 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sec31aQ3UPL0 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sec31aQ3UPL0 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sec31aQ3UPL0 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sec31aQ3UPL0 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sec31aQ3UPL0 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sec31aQ3UPL0 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sec31aQ3UPL0 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sec31aQ3UPL0 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sec31aQ3UPL0 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sec31aQ3UPL0 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sec31aQ3UPL0 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sec31aQ3UPL0 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sec31aQ3UPL0 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sec31aQ3UPL0 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sec31aQ3UPL0 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sec31aQ3UPL0 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Sec31aQ3UPL0 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sec31aQ3UPL0 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sec31aQ3UPL0 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sec31aQ3UPL0 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sec31aQ3UPL0 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sec31aQ3UPL0 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sec31aQ3UPL0 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sec31aQ3UPL0 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Sec31aQ3UPL0 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sec31aQ3UPL0 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sec31aQ3UPL0 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sec31aQ3UPL0 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sec31aQ3UPL0 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sec31aQ3UPL0 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sec31aQ3UPL0 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Sec31aQ3UPL0 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sec31aQ3UPL0 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sec31aQ3UPL0 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Sec31aQ3UPL0 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Sec31aQ3UPL0 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sec31aQ3UPL0 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sec31aQ3UPL0 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sec31aQ3UPL0 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sec31aQ3UPL0 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sec31aQ3UPL0 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sec31aQ3UPL0 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Sec31aQ3UPL0 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sec31aQ3UPL0 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sec31aQ3UPL0 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sec31aQ3UPL0 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sec31aQ3UPL0 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sec31aQ3UPL0 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sec31aQ3UPL0 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sec31aQ3UPL0 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sec31aQ3UPL0 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sec31aQ3UPL0 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sec31aQ3UPL0 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sec31aQ3UPL0 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sec31aQ3UPL0 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sec31aQ3UPL0 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sec31aQ3UPL0 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Sec31aQ3UPL0 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sec31aQ3UPL0 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sec31aQ3UPL0 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sec31aQ3UPL0 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sec31aQ3UPL0 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sec31aQ3UPL0 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sec31aQ3UPL0 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sec31aQ3UPL0 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Sec31aQ3UPL0 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sec31aQ3UPL0 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Sec31aQ3UPL0 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Sec31aQ3UPL0 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Sec31aQ3UPL0 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sec31aQ3UPL0 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sec31aQ3UPL0 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sec31aQ3UPL0 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sec31aQ3UPL0 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sec31aQ3UPL0 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sec31aQ3UPL0 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sec31aQ3UPL0 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sec31aQ3UPL0 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sec31aQ3UPL0 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sec31aQ3UPL0 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sec31aQ3UPL0 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Sec31aQ3UPL0 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Sec31aQ3UPL0 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Sec31aQ3UPL0 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC12.83□□□□□ -0.35
Sec31aQ3UPL0 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sec31aQ3UPL0 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms