Protein–RNA interactions for Protein: Q3U1D9

UPF0602 protein C4orf47 homolog, mousemouse

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Length 316 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U1D9 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Q3U1D9 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Q3U1D9 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Q3U1D9 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Lmo7-205ENSMUST00000159314 5774 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q3U1D9 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Q3U1D9 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q3U1D9 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
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Q3U1D9 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q3U1D9 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Q3U1D9 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Q3U1D9 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
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