Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0M1

Trappc9, Trafficking protein particle complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc9Q3U0M1 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Trappc9Q3U0M1 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Trappc9Q3U0M1 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Trappc9Q3U0M1 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Trappc9Q3U0M1 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Trappc9Q3U0M1 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Trappc9Q3U0M1 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Trappc9Q3U0M1 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Trappc9Q3U0M1 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Trappc9Q3U0M1 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Trappc9Q3U0M1 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Trappc9Q3U0M1 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Trappc9Q3U0M1 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Trappc9Q3U0M1 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Trappc9Q3U0M1 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Trappc9Q3U0M1 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Trappc9Q3U0M1 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Trappc9Q3U0M1 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Trappc9Q3U0M1 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Trappc9Q3U0M1 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Trappc9Q3U0M1 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Trappc9Q3U0M1 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Trappc9Q3U0M1 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Trappc9Q3U0M1 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Trappc9Q3U0M1 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Trappc9Q3U0M1 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Trappc9Q3U0M1 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Trappc9Q3U0M1 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Trappc9Q3U0M1 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Trappc9Q3U0M1 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Trappc9Q3U0M1 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Trappc9Q3U0M1 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Trappc9Q3U0M1 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trappc9Q3U0M1 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trappc9Q3U0M1 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trappc9Q3U0M1 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trappc9Q3U0M1 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Trappc9Q3U0M1 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trappc9Q3U0M1 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trappc9Q3U0M1 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trappc9Q3U0M1 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trappc9Q3U0M1 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trappc9Q3U0M1 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trappc9Q3U0M1 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trappc9Q3U0M1 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trappc9Q3U0M1 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trappc9Q3U0M1 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Trappc9Q3U0M1 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trappc9Q3U0M1 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trappc9Q3U0M1 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trappc9Q3U0M1 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trappc9Q3U0M1 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trappc9Q3U0M1 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trappc9Q3U0M1 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trappc9Q3U0M1 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Trappc9Q3U0M1 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trappc9Q3U0M1 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trappc9Q3U0M1 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trappc9Q3U0M1 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trappc9Q3U0M1 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trappc9Q3U0M1 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trappc9Q3U0M1 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trappc9Q3U0M1 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trappc9Q3U0M1 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trappc9Q3U0M1 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trappc9Q3U0M1 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trappc9Q3U0M1 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trappc9Q3U0M1 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trappc9Q3U0M1 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trappc9Q3U0M1 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trappc9Q3U0M1 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trappc9Q3U0M1 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trappc9Q3U0M1 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Trappc9Q3U0M1 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trappc9Q3U0M1 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trappc9Q3U0M1 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trappc9Q3U0M1 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trappc9Q3U0M1 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trappc9Q3U0M1 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Trappc9Q3U0M1 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trappc9Q3U0M1 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Trappc9Q3U0M1 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trappc9Q3U0M1 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trappc9Q3U0M1 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trappc9Q3U0M1 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trappc9Q3U0M1 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trappc9Q3U0M1 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trappc9Q3U0M1 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Trappc9Q3U0M1 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Trappc9Q3U0M1 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Trappc9Q3U0M1 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Trappc9Q3U0M1 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trappc9Q3U0M1 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trappc9Q3U0M1 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Trappc9Q3U0M1 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trappc9Q3U0M1 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Trappc9Q3U0M1 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Trappc9Q3U0M1 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trappc9Q3U0M1 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Trappc9Q3U0M1 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 452.6 ms