Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccndbp1Q3TVC7 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccndbp1Q3TVC7 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccndbp1Q3TVC7 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccndbp1Q3TVC7 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccndbp1Q3TVC7 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
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