Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usp39Q3TIX9 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usp39Q3TIX9 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usp39Q3TIX9 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usp39Q3TIX9 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usp39Q3TIX9 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usp39Q3TIX9 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usp39Q3TIX9 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usp39Q3TIX9 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usp39Q3TIX9 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usp39Q3TIX9 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usp39Q3TIX9 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Usp39Q3TIX9 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usp39Q3TIX9 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usp39Q3TIX9 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usp39Q3TIX9 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usp39Q3TIX9 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usp39Q3TIX9 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Usp39Q3TIX9 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Usp39Q3TIX9 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Usp39Q3TIX9 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usp39Q3TIX9 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Usp39Q3TIX9 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usp39Q3TIX9 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usp39Q3TIX9 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Usp39Q3TIX9 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usp39Q3TIX9 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Usp39Q3TIX9 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Usp39Q3TIX9 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usp39Q3TIX9 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Usp39Q3TIX9 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Usp39Q3TIX9 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usp39Q3TIX9 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usp39Q3TIX9 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usp39Q3TIX9 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usp39Q3TIX9 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usp39Q3TIX9 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usp39Q3TIX9 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usp39Q3TIX9 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usp39Q3TIX9 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usp39Q3TIX9 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usp39Q3TIX9 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usp39Q3TIX9 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usp39Q3TIX9 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usp39Q3TIX9 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usp39Q3TIX9 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usp39Q3TIX9 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usp39Q3TIX9 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usp39Q3TIX9 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usp39Q3TIX9 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usp39Q3TIX9 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usp39Q3TIX9 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usp39Q3TIX9 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usp39Q3TIX9 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usp39Q3TIX9 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usp39Q3TIX9 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usp39Q3TIX9 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usp39Q3TIX9 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usp39Q3TIX9 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usp39Q3TIX9 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usp39Q3TIX9 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usp39Q3TIX9 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usp39Q3TIX9 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usp39Q3TIX9 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usp39Q3TIX9 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usp39Q3TIX9 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usp39Q3TIX9 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Usp39Q3TIX9 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Usp39Q3TIX9 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Usp39Q3TIX9 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Usp39Q3TIX9 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usp39Q3TIX9 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usp39Q3TIX9 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Usp39Q3TIX9 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Usp39Q3TIX9 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usp39Q3TIX9 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usp39Q3TIX9 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usp39Q3TIX9 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usp39Q3TIX9 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usp39Q3TIX9 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usp39Q3TIX9 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usp39Q3TIX9 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usp39Q3TIX9 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usp39Q3TIX9 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usp39Q3TIX9 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usp39Q3TIX9 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usp39Q3TIX9 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usp39Q3TIX9 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usp39Q3TIX9 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usp39Q3TIX9 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usp39Q3TIX9 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usp39Q3TIX9 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usp39Q3TIX9 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usp39Q3TIX9 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usp39Q3TIX9 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usp39Q3TIX9 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usp39Q3TIX9 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usp39Q3TIX9 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usp39Q3TIX9 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Usp39Q3TIX9 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms