Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIR1

Trappc13, Trafficking protein particle complex subunit 13, mousemouse

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Length 417 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc13Q3TIR1 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Trappc13Q3TIR1 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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Trappc13Q3TIR1 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms