Protein–RNA interactions for Protein: Q3MI99

Ccbe1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 408 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccbe1Q3MI99 Zfp617-201ENSMUST00000119003 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ccbe1Q3MI99 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ccbe1Q3MI99 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ccbe1Q3MI99 4732491K20Rik-201ENSMUST00000181774 3142 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ccbe1Q3MI99 Khnyn-201ENSMUST00000022831 3898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ccbe1Q3MI99 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ccbe1Q3MI99 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ccbe1Q3MI99 Ldb2-204ENSMUST00000199256 2596 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ccbe1Q3MI99 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Ccbe1Q3MI99 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ccbe1Q3MI99 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ccbe1Q3MI99 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Ccbe1Q3MI99 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ccbe1Q3MI99 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ccbe1Q3MI99 Ilf3-208ENSMUST00000214758 3177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ccbe1Q3MI99 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ccbe1Q3MI99 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ccbe1Q3MI99 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ccbe1Q3MI99 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Ccbe1Q3MI99 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ccbe1Q3MI99 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Ccbe1Q3MI99 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Ccbe1Q3MI99 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ccbe1Q3MI99 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ccbe1Q3MI99 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Ccbe1Q3MI99 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Ccbe1Q3MI99 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ccbe1Q3MI99 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ccbe1Q3MI99 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ccbe1Q3MI99 Lipg-201ENSMUST00000066532 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ccbe1Q3MI99 Synj2-203ENSMUST00000115784 2634 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ccbe1Q3MI99 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ccbe1Q3MI99 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ccbe1Q3MI99 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ccbe1Q3MI99 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ccbe1Q3MI99 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ccbe1Q3MI99 Poldip3-202ENSMUST00000100375 3157 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ccbe1Q3MI99 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ccbe1Q3MI99 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ccbe1Q3MI99 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ccbe1Q3MI99 Sorbs3-201ENSMUST00000022682 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ccbe1Q3MI99 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ccbe1Q3MI99 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ccbe1Q3MI99 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ccbe1Q3MI99 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Ccbe1Q3MI99 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ccbe1Q3MI99 4933415A04Rik-201ENSMUST00000056256 2009 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ccbe1Q3MI99 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ccbe1Q3MI99 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ccbe1Q3MI99 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ccbe1Q3MI99 4933407I05Rik-204ENSMUST00000217562 1561 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Ccbe1Q3MI99 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ccbe1Q3MI99 Gatb-203ENSMUST00000107674 1980 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ccbe1Q3MI99 Rbbp5-202ENSMUST00000187505 1977 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ccbe1Q3MI99 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ccbe1Q3MI99 Crot-201ENSMUST00000003720 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ccbe1Q3MI99 Adat1-201ENSMUST00000034427 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ccbe1Q3MI99 4933413J09Rik-202ENSMUST00000059648 3387 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ccbe1Q3MI99 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ccbe1Q3MI99 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ccbe1Q3MI99 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ccbe1Q3MI99 Bcl11a-204ENSMUST00000118955 1505 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ccbe1Q3MI99 Gal3st2b-202ENSMUST00000178757 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ccbe1Q3MI99 Trpv6-201ENSMUST00000031902 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ccbe1Q3MI99 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
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Ccbe1Q3MI99 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
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Ccbe1Q3MI99 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
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Ccbe1Q3MI99 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
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Ccbe1Q3MI99 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ccbe1Q3MI99 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Ccbe1Q3MI99 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Ccbe1Q3MI99 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ccbe1Q3MI99 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
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Ccbe1Q3MI99 Traf1-207ENSMUST00000172159 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ccbe1Q3MI99 Rcan2-201ENSMUST00000044792 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ccbe1Q3MI99 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ccbe1Q3MI99 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ccbe1Q3MI99 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ccbe1Q3MI99 Nxpe5-204ENSMUST00000161047 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ccbe1Q3MI99 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ccbe1Q3MI99 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ccbe1Q3MI99 Gm44914-201ENSMUST00000207191 2720 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Ccbe1Q3MI99 Gm26658-201ENSMUST00000181067 2500 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Ccbe1Q3MI99 Isl1-201ENSMUST00000036060 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Ccbe1Q3MI99 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Ccbe1Q3MI99 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Ccbe1Q3MI99 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Ccbe1Q3MI99 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Ccbe1Q3MI99 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Ccbe1Q3MI99 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Ccbe1Q3MI99 Tnfrsf9-201ENSMUST00000030808 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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