Protein–RNA interactions for Protein: Q149B8

Perm1, PGC-1 and ERR-induced regulator in muscle protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 807 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Perm1Q149B8 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Perm1Q149B8 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Perm1Q149B8 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Perm1Q149B8 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Perm1Q149B8 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Perm1Q149B8 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Perm1Q149B8 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Perm1Q149B8 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Perm1Q149B8 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Perm1Q149B8 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Perm1Q149B8 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Perm1Q149B8 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Perm1Q149B8 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Perm1Q149B8 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Perm1Q149B8 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Perm1Q149B8 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Perm1Q149B8 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Perm1Q149B8 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Perm1Q149B8 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Perm1Q149B8 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Perm1Q149B8 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Perm1Q149B8 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Perm1Q149B8 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Perm1Q149B8 Cdc42se1-203ENSMUST00000107200 637 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Perm1Q149B8 Gm15036-201ENSMUST00000118880 400 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Perm1Q149B8 Tbata-203ENSMUST00000121297 1000 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Perm1Q149B8 BB557941-201ENSMUST00000126549 1097 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Perm1Q149B8 Hcrtr1-204ENSMUST00000164887 1251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Perm1Q149B8 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Perm1Q149B8 1700063K16Rik-201ENSMUST00000190306 369 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Perm1Q149B8 Znhit6-206ENSMUST00000199033 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Perm1Q149B8 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Perm1Q149B8 Gm3017-201ENSMUST00000203603 1126 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Perm1Q149B8 AC168279.1-201ENSMUST00000214611 382 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Perm1Q149B8 AC153961.1-201ENSMUST00000217760 385 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Perm1Q149B8 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Perm1Q149B8 Gm46336-201ENSMUST00000221894 279 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Perm1Q149B8 Mcts2-201ENSMUST00000062148 917 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Perm1Q149B8 1700001K19Rik-201ENSMUST00000070659 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Perm1Q149B8 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Perm1Q149B8 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Perm1Q149B8 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Perm1Q149B8 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Perm1Q149B8 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Perm1Q149B8 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Perm1Q149B8 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Perm1Q149B8 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Perm1Q149B8 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Perm1Q149B8 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Perm1Q149B8 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Perm1Q149B8 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Perm1Q149B8 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Perm1Q149B8 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Perm1Q149B8 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Perm1Q149B8 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Perm1Q149B8 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Perm1Q149B8 Rpl4-201ENSMUST00000034966 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Perm1Q149B8 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Perm1Q149B8 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Perm1Q149B8 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Perm1Q149B8 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Perm1Q149B8 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Perm1Q149B8 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Perm1Q149B8 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Perm1Q149B8 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Perm1Q149B8 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Perm1Q149B8 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Perm1Q149B8 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Perm1Q149B8 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Perm1Q149B8 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Perm1Q149B8 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Perm1Q149B8 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Perm1Q149B8 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Perm1Q149B8 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Perm1Q149B8 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Perm1Q149B8 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Perm1Q149B8 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Perm1Q149B8 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Perm1Q149B8 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Perm1Q149B8 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Perm1Q149B8 Gm25766-201ENSMUST00000104101 131 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Perm1Q149B8 Gm21987-201ENSMUST00000119704 456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Perm1Q149B8 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Perm1Q149B8 Gm11354-201ENSMUST00000121974 422 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Perm1Q149B8 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Perm1Q149B8 1700099I09Rik-201ENSMUST00000167834 769 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Perm1Q149B8 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Perm1Q149B8 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Perm1Q149B8 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Perm1Q149B8 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Perm1Q149B8 A930005H10Rik-204ENSMUST00000185681 625 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Perm1Q149B8 A930005H10Rik-206ENSMUST00000188260 739 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Perm1Q149B8 Gm9508-201ENSMUST00000220084 693 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Perm1Q149B8 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Perm1Q149B8 Rasl11a-201ENSMUST00000031646 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Perm1Q149B8 Llph-201ENSMUST00000020444 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Perm1Q149B8 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Perm1Q149B8 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Perm1Q149B8 2610301B20Rik-202ENSMUST00000101504 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Perm1Q149B8 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms