Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBD0

Itgb8, Integrin beta, mousemouse

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Length 767 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb8Q0VBD0 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Nfic-201ENSMUST00000020461 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Dld-201ENSMUST00000110857 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Gphb5-201ENSMUST00000051079 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Sema4a-201ENSMUST00000029700 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 AC129336.2-201ENSMUST00000218053 3086 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Cox17-202ENSMUST00000120495 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Sgk1-213ENSMUST00000164659 2602 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Itgb8Q0VBD0 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Itgb8Q0VBD0 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Itgb8Q0VBD0 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Gm37333-201ENSMUST00000192904 2251 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Slc22a14-201ENSMUST00000093775 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Gm26737-201ENSMUST00000181106 2151 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms