Protein–RNA interactions for Protein: Q08874

Mitf, Microphthalmia-associated transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MitfQ08874 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
MitfQ08874 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
MitfQ08874 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
MitfQ08874 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
MitfQ08874 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
MitfQ08874 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
MitfQ08874 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
MitfQ08874 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
MitfQ08874 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
MitfQ08874 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
MitfQ08874 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
MitfQ08874 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
MitfQ08874 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
MitfQ08874 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
MitfQ08874 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
MitfQ08874 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
MitfQ08874 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
MitfQ08874 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
MitfQ08874 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
MitfQ08874 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
MitfQ08874 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
MitfQ08874 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
MitfQ08874 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
MitfQ08874 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
MitfQ08874 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
MitfQ08874 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
MitfQ08874 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
MitfQ08874 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
MitfQ08874 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
MitfQ08874 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
MitfQ08874 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
MitfQ08874 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
MitfQ08874 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
MitfQ08874 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
MitfQ08874 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
MitfQ08874 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
MitfQ08874 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
MitfQ08874 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
MitfQ08874 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
MitfQ08874 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
MitfQ08874 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
MitfQ08874 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
MitfQ08874 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
MitfQ08874 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
MitfQ08874 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
MitfQ08874 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
MitfQ08874 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
MitfQ08874 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
MitfQ08874 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
MitfQ08874 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
MitfQ08874 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
MitfQ08874 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
MitfQ08874 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
MitfQ08874 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
MitfQ08874 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
MitfQ08874 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
MitfQ08874 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
MitfQ08874 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
MitfQ08874 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
MitfQ08874 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
MitfQ08874 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
MitfQ08874 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
MitfQ08874 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
MitfQ08874 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
MitfQ08874 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
MitfQ08874 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
MitfQ08874 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
MitfQ08874 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
MitfQ08874 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
MitfQ08874 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
MitfQ08874 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
MitfQ08874 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
MitfQ08874 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
MitfQ08874 Ccdc62-201ENSMUST00000094320 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
MitfQ08874 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
MitfQ08874 Tbc1d14-202ENSMUST00000124036 2765 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
MitfQ08874 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
MitfQ08874 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
MitfQ08874 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
MitfQ08874 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
MitfQ08874 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
MitfQ08874 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
MitfQ08874 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
MitfQ08874 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
MitfQ08874 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
MitfQ08874 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
MitfQ08874 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
MitfQ08874 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
MitfQ08874 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
MitfQ08874 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
MitfQ08874 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
MitfQ08874 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
MitfQ08874 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
MitfQ08874 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
MitfQ08874 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
MitfQ08874 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
MitfQ08874 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
MitfQ08874 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
MitfQ08874 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
MitfQ08874 4933413J09Rik-202ENSMUST00000059648 3387 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.8 ms