Protein–RNA interactions for Protein: Q08535

Sct, Secretin, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SctQ08535 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
SctQ08535 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SctQ08535 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SctQ08535 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SctQ08535 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SctQ08535 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SctQ08535 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SctQ08535 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SctQ08535 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SctQ08535 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SctQ08535 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SctQ08535 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SctQ08535 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SctQ08535 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SctQ08535 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SctQ08535 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SctQ08535 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SctQ08535 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SctQ08535 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SctQ08535 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SctQ08535 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SctQ08535 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SctQ08535 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SctQ08535 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SctQ08535 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
SctQ08535 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SctQ08535 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SctQ08535 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SctQ08535 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SctQ08535 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SctQ08535 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SctQ08535 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SctQ08535 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SctQ08535 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SctQ08535 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SctQ08535 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SctQ08535 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SctQ08535 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SctQ08535 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SctQ08535 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
SctQ08535 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
SctQ08535 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SctQ08535 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
SctQ08535 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SctQ08535 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SctQ08535 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SctQ08535 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SctQ08535 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
SctQ08535 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
SctQ08535 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SctQ08535 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SctQ08535 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
SctQ08535 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SctQ08535 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
SctQ08535 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SctQ08535 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SctQ08535 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
SctQ08535 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SctQ08535 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SctQ08535 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SctQ08535 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SctQ08535 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SctQ08535 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SctQ08535 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SctQ08535 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SctQ08535 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SctQ08535 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SctQ08535 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SctQ08535 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
SctQ08535 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SctQ08535 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SctQ08535 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SctQ08535 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SctQ08535 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SctQ08535 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SctQ08535 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SctQ08535 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SctQ08535 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SctQ08535 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SctQ08535 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SctQ08535 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SctQ08535 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SctQ08535 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SctQ08535 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SctQ08535 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SctQ08535 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SctQ08535 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SctQ08535 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SctQ08535 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
SctQ08535 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SctQ08535 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
SctQ08535 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
SctQ08535 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SctQ08535 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
SctQ08535 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
SctQ08535 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SctQ08535 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
SctQ08535 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SctQ08535 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SctQ08535 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms