Protein–RNA interactions for Protein: Q06138

Cab39, Calcium-binding protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cab39Q06138 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Otog-201ENSMUST00000164538 10043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Plekhg4-206ENSMUST00000214056 3654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Gm37057-201ENSMUST00000192624 1916 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 C2cd5-213ENSMUST00000204655 3526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Ptprg-201ENSMUST00000022264 9213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Tor1aip2-201ENSMUST00000060404 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Cacna1c-226ENSMUST00000219833 7591 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Tardbp-206ENSMUST00000105702 6425 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 Ern1-201ENSMUST00000001059 6946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 Gm26642-201ENSMUST00000180981 2782 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 Slc6a18-201ENSMUST00000022105 2839 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 Fbln2-202ENSMUST00000113498 4644 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 Zfp174-201ENSMUST00000041778 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 Manea-201ENSMUST00000041374 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.4 ms