Protein–RNA interactions for Protein: Q04683

Cxcr5, C-X-C chemokine receptor type 5, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr5Q04683 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cxcr5Q04683 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cxcr5Q04683 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cxcr5Q04683 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cxcr5Q04683 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cxcr5Q04683 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cxcr5Q04683 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cxcr5Q04683 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cxcr5Q04683 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cxcr5Q04683 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cxcr5Q04683 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cxcr5Q04683 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Cxcr5Q04683 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cxcr5Q04683 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cxcr5Q04683 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cxcr5Q04683 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cxcr5Q04683 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cxcr5Q04683 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cxcr5Q04683 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cxcr5Q04683 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cxcr5Q04683 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cxcr5Q04683 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cxcr5Q04683 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cxcr5Q04683 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cxcr5Q04683 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cxcr5Q04683 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cxcr5Q04683 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cxcr5Q04683 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cxcr5Q04683 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cxcr5Q04683 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cxcr5Q04683 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cxcr5Q04683 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cxcr5Q04683 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cxcr5Q04683 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cxcr5Q04683 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cxcr5Q04683 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cxcr5Q04683 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cxcr5Q04683 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cxcr5Q04683 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cxcr5Q04683 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cxcr5Q04683 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cxcr5Q04683 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cxcr5Q04683 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cxcr5Q04683 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cxcr5Q04683 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cxcr5Q04683 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cxcr5Q04683 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cxcr5Q04683 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Cxcr5Q04683 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cxcr5Q04683 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cxcr5Q04683 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cxcr5Q04683 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Cxcr5Q04683 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cxcr5Q04683 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cxcr5Q04683 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Cxcr5Q04683 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cxcr5Q04683 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Cxcr5Q04683 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cxcr5Q04683 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cxcr5Q04683 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cxcr5Q04683 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Cxcr5Q04683 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cxcr5Q04683 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cxcr5Q04683 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cxcr5Q04683 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cxcr5Q04683 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cxcr5Q04683 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cxcr5Q04683 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cxcr5Q04683 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Cxcr5Q04683 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Cxcr5Q04683 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Cxcr5Q04683 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Cxcr5Q04683 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC11.4□□□□□ -0.59
Cxcr5Q04683 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cxcr5Q04683 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cxcr5Q04683 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cxcr5Q04683 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cxcr5Q04683 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cxcr5Q04683 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Cxcr5Q04683 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Cxcr5Q04683 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cxcr5Q04683 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cxcr5Q04683 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cxcr5Q04683 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cxcr5Q04683 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cxcr5Q04683 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cxcr5Q04683 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cxcr5Q04683 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cxcr5Q04683 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cxcr5Q04683 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cxcr5Q04683 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cxcr5Q04683 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Cxcr5Q04683 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Cxcr5Q04683 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Cxcr5Q04683 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Cxcr5Q04683 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cxcr5Q04683 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cxcr5Q04683 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Cxcr5Q04683 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cxcr5Q04683 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms