Protein–RNA interactions for Protein: Q01727

Mc1r, Melanocyte-stimulating hormone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mc1rQ01727 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Mc1rQ01727 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Mc1rQ01727 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Mc1rQ01727 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Mc1rQ01727 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Mc1rQ01727 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Mc1rQ01727 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Mc1rQ01727 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Mc1rQ01727 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Mc1rQ01727 Gm37444-201ENSMUST00000193605 439 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Mc1rQ01727 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Mc1rQ01727 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Mc1rQ01727 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Mc1rQ01727 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Mc1rQ01727 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Mc1rQ01727 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Mc1rQ01727 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Mc1rQ01727 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Mc1rQ01727 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Mc1rQ01727 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Mc1rQ01727 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Mc1rQ01727 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Mc1rQ01727 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Mc1rQ01727 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Mc1rQ01727 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Mc1rQ01727 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Mc1rQ01727 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Mc1rQ01727 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Mc1rQ01727 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Mc1rQ01727 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Mc1rQ01727 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Mc1rQ01727 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Mc1rQ01727 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Mc1rQ01727 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Mc1rQ01727 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Mc1rQ01727 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Mc1rQ01727 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Mc1rQ01727 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Mc1rQ01727 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Mc1rQ01727 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Mc1rQ01727 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Mc1rQ01727 Gm14091-201ENSMUST00000133534 874 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Mc1rQ01727 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Mc1rQ01727 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Mc1rQ01727 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Mc1rQ01727 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Mc1rQ01727 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Mc1rQ01727 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Mc1rQ01727 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Mc1rQ01727 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Mc1rQ01727 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Mc1rQ01727 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Mc1rQ01727 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Mc1rQ01727 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Mc1rQ01727 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Mc1rQ01727 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Mc1rQ01727 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Mc1rQ01727 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Mc1rQ01727 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Mc1rQ01727 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Mc1rQ01727 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Mc1rQ01727 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Mc1rQ01727 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Mc1rQ01727 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Mc1rQ01727 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Mc1rQ01727 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Mc1rQ01727 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Mc1rQ01727 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Mc1rQ01727 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Mc1rQ01727 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Mc1rQ01727 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Mc1rQ01727 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Mc1rQ01727 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Mc1rQ01727 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Mc1rQ01727 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Mc1rQ01727 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Mc1rQ01727 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Mc1rQ01727 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Mc1rQ01727 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Mc1rQ01727 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Mc1rQ01727 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Mc1rQ01727 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Mc1rQ01727 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Mc1rQ01727 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Mc1rQ01727 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Mc1rQ01727 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Mc1rQ01727 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Mc1rQ01727 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Mc1rQ01727 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Mc1rQ01727 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Mc1rQ01727 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Mc1rQ01727 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Mc1rQ01727 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Mc1rQ01727 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Mc1rQ01727 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Mc1rQ01727 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Mc1rQ01727 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Mc1rQ01727 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Mc1rQ01727 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Mc1rQ01727 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms