Protein–RNA interactions for Protein: P61406

Smg6, Telomerase-binding protein EST1A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg6P61406 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smg6P61406 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smg6P61406 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smg6P61406 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smg6P61406 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smg6P61406 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smg6P61406 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smg6P61406 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smg6P61406 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smg6P61406 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smg6P61406 Gm11628-201ENSMUST00000117568 171 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Smg6P61406 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Smg6P61406 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smg6P61406 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Smg6P61406 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smg6P61406 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Smg6P61406 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Smg6P61406 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smg6P61406 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smg6P61406 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smg6P61406 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smg6P61406 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smg6P61406 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smg6P61406 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smg6P61406 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smg6P61406 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smg6P61406 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smg6P61406 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smg6P61406 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smg6P61406 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smg6P61406 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smg6P61406 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Smg6P61406 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smg6P61406 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smg6P61406 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smg6P61406 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smg6P61406 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smg6P61406 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smg6P61406 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smg6P61406 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Smg6P61406 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smg6P61406 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smg6P61406 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smg6P61406 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smg6P61406 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Smg6P61406 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smg6P61406 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smg6P61406 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smg6P61406 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smg6P61406 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smg6P61406 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smg6P61406 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smg6P61406 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smg6P61406 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smg6P61406 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smg6P61406 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Smg6P61406 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Smg6P61406 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smg6P61406 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smg6P61406 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smg6P61406 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smg6P61406 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smg6P61406 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smg6P61406 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smg6P61406 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smg6P61406 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smg6P61406 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smg6P61406 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smg6P61406 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smg6P61406 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smg6P61406 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smg6P61406 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smg6P61406 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smg6P61406 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smg6P61406 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smg6P61406 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smg6P61406 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smg6P61406 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smg6P61406 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smg6P61406 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smg6P61406 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smg6P61406 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smg6P61406 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smg6P61406 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Smg6P61406 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smg6P61406 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smg6P61406 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smg6P61406 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smg6P61406 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smg6P61406 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Smg6P61406 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Smg6P61406 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smg6P61406 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smg6P61406 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smg6P61406 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smg6P61406 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smg6P61406 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smg6P61406 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smg6P61406 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smg6P61406 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms