Protein–RNA interactions for Protein: P59016

Vps33b, Vacuolar protein sorting-associated protein 33B, mousemouse

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Length 617 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps33bP59016 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vps33bP59016 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vps33bP59016 Mir181d-201ENSMUST00000102383 72 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Vps33bP59016 Gm15528-201ENSMUST00000117821 864 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Vps33bP59016 Gm15196-201ENSMUST00000121406 482 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Vps33bP59016 Gm13707-201ENSMUST00000123663 600 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vps33bP59016 Polr3c-205ENSMUST00000141377 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vps33bP59016 Ins2-208ENSMUST00000162317 297 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vps33bP59016 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vps33bP59016 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vps33bP59016 4933402C05Rik-201ENSMUST00000208189 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vps33bP59016 Gm20735-202ENSMUST00000212387 519 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vps33bP59016 BC106175-201ENSMUST00000218578 695 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vps33bP59016 Ctxn2-201ENSMUST00000099452 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vps33bP59016 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Vps33bP59016 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vps33bP59016 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vps33bP59016 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vps33bP59016 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vps33bP59016 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vps33bP59016 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Vps33bP59016 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Vps33bP59016 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vps33bP59016 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vps33bP59016 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vps33bP59016 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Vps33bP59016 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Vps33bP59016 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Vps33bP59016 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Vps33bP59016 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Vps33bP59016 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Vps33bP59016 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Vps33bP59016 Gm6170-201ENSMUST00000187672 1388 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Vps33bP59016 Gm45218-201ENSMUST00000205533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Vps33bP59016 Gm6831-202ENSMUST00000213025 1673 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Vps33bP59016 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Vps33bP59016 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Vps33bP59016 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Vps33bP59016 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Vps33bP59016 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Vps33bP59016 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Vps33bP59016 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Vps33bP59016 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC15□□□□□ -0.01
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Vps33bP59016 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Vps33bP59016 Slfn5os-201ENSMUST00000127074 574 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Vps33bP59016 Gm11634-201ENSMUST00000154147 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
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Vps33bP59016 Gm13277-201ENSMUST00000178480 549 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Vps33bP59016 Gm13279-201ENSMUST00000178602 549 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Vps33bP59016 Gm13289-201ENSMUST00000179158 549 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Vps33bP59016 Gm13276-201ENSMUST00000179372 549 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Vps33bP59016 Gm13287-201ENSMUST00000179490 549 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Vps33bP59016 1700017I07Rik-201ENSMUST00000184823 462 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Vps33bP59016 Gm29261-201ENSMUST00000188535 678 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Vps33bP59016 Nmbr-207ENSMUST00000190751 921 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Vps33bP59016 Gm37365-201ENSMUST00000193109 409 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Vps33bP59016 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Vps33bP59016 Gm2594-201ENSMUST00000214774 742 ntBASIC15□□□□□ -0.01
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Vps33bP59016 Adipoq-201ENSMUST00000023593 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Vps33bP59016 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Vps33bP59016 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Vps33bP59016 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Vps33bP59016 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Vps33bP59016 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Vps33bP59016 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Vps33bP59016 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Vps33bP59016 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Vps33bP59016 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Vps33bP59016 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Vps33bP59016 Cast-212ENSMUST00000223309 1529 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Vps33bP59016 Plac8-203ENSMUST00000112910 1224 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Vps33bP59016 Gm13530-201ENSMUST00000134014 390 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Vps33bP59016 Gm15911-201ENSMUST00000138992 809 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Vps33bP59016 Gm11417-201ENSMUST00000150536 920 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Vps33bP59016 Pfdn5-203ENSMUST00000165671 830 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Vps33bP59016 Gm26272-201ENSMUST00000179241 132 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Vps33bP59016 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Vps33bP59016 Gm45094-201ENSMUST00000207013 617 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Vps33bP59016 Ftl1-204ENSMUST00000210864 503 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Vps33bP59016 Gm45527-201ENSMUST00000211052 774 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Vps33bP59016 Gpr137b-ps-202ENSMUST00000220647 1159 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Vps33bP59016 Tsga10ip-201ENSMUST00000044527 487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Vps33bP59016 Naa10-202ENSMUST00000096316 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Vps33bP59016 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Vps33bP59016 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Vps33bP59016 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Vps33bP59016 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
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