Protein–RNA interactions for Protein: P20040

H-2 class II histocompatibility antigen, E-Q beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P20040 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
P20040 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P20040 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P20040 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P20040 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P20040 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P20040 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P20040 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P20040 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P20040 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P20040 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P20040 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P20040 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P20040 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P20040 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P20040 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P20040 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P20040 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P20040 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P20040 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P20040 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P20040 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P20040 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
P20040 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P20040 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P20040 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P20040 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P20040 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
P20040 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P20040 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P20040 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P20040 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P20040 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P20040 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
P20040 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
P20040 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
P20040 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
P20040 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P20040 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P20040 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P20040 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
P20040 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P20040 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P20040 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P20040 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P20040 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P20040 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
P20040 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P20040 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P20040 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P20040 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P20040 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P20040 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P20040 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P20040 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P20040 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P20040 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
P20040 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
P20040 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
P20040 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P20040 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P20040 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P20040 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P20040 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
P20040 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P20040 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P20040 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
P20040 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
P20040 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P20040 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P20040 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P20040 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
P20040 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
P20040 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
P20040 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
P20040 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
P20040 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
P20040 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
P20040 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P20040 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P20040 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
P20040 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
P20040 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P20040 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P20040 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
P20040 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P20040 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P20040 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P20040 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
P20040 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P20040 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P20040 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
P20040 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P20040 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P20040 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P20040 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P20040 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P20040 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P20040 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P20040 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
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